{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0004758099013866916],
[446.2520221384517, 1014.902404419367, 1, 0, 0.3054105808581303, 0.002240886204185637, 0, -0.02897838938688981, 1, 0.3054105808581303, 0.0004730759851070409],
[446.2230338428299, 1014.906227343678, 0, 1, 0.305396001364366, 0, 0.0009853127048173778, 0.01274173368318093, 0.694603998635634, 1, 0.000475225423622616],
[446.2230338428299, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053897048162612, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946102951837388, 1, 0.000475131252077321],
[446.1940455472081, 1015.08586608751, 1, 0, 0.3053446789999704, 0.002241177375582432, 0, -0.02898215471781062, 1, 0.3053446789999703, 0.000475895280484179],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004757288074201536],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004753307064190939],
[446.3326121565124, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3054428294056018, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054428294056017, 0.0004764259189730885],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754019401135865],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754161868525478],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0004754161868525478],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004754304335915309],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004754304335915309],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754446803305343],
[446.3861752641226, 1014.768251293696, 0, 1, 0.3055023939637355, 0, 0.0009854466758544443, 0.01274346615173352, 0.6944976060362645, 1, 0.000476543811264341],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760554375884685],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004760836536512185],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760836640075213],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004760836640075213],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760836640075213],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0004760836640075213],
[446.2180735401726, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053873467648257, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946126532351744, 1, 0.0004760836536512185],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.000476111881017976],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004761118910699319],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004762033351201196],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0004761236956743759],
[446.5598924215372, 1014.594534136281, 0, 1, 0.3056212843111601, 0, 0.00098561540236494, 0.01274564806642062, 0.6943787156888399, 1, 0.000476123695947954],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.000476111891074688],
[446.2230338428299, 1014.873197091549, 0, 1, 0.3054029052949291, 0, 0.000985344772988219, 0.01274214837801899, 0.6945970947050708, 1, 0.0004761236856575485],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.000476111881017976],
[446.3326121565124, 1014.853402158142, 1, 0, 0.3054591323650585, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054591323650585, 0.0004762315355500476],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004761401090296941],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004761401090228956],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004761401193807489],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004241906190125241],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006954936505963074],
[445.0038772154651, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3052182936580652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002771150515649534],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004181771271602641],
[445.4421904701948, 1012.762566830245, 0, 0, 0.3054730059273965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002814431903010537],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004136226133946554],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002891485113709387],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.000406119914684547],
[444.6196177816361, 1013.481553867825, 0, 0, 0.3049305675261648, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003025927315713989],
[445.921325812233, 1015.181307920097, 1, 0, 0.3051950735816172, 0.002242548050776734, 0, -0.02899987983005829, 1, 0.3051950735816171, 0.0003927522295836157],
[444.5493166854154, 1013.92492798501, 0, 0, 0.3048043654592415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002503817961272746],
[445.8861752641226, 1015.402994978689, 0, 1, 0.3051320603368552, 0, 0.0009848306583151137, 0.01273550001936565, 0.6948679396631448, 1, 0.0004451758629018508],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006956950839707754],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956951273571549],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006956951137578796],
[444.9574744154548, 1013.247282884984, 1, 0, 0.3051405998970957, 0.002247405780324761, 0, -0.02906269836056465, 1, 0.3051405998970957, 0.0006958719830194357],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006956951237803904],
[446.4251487365443, 1014.619699507592, 0, 1, 0.3055519817020347, 0, 0.0009855909563803197, 0.01274533193914028, 0.6944480182979653, 1, 0.0006956951541558939],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950776391846],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950963060253],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950741842542],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956343247871664],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950832255069],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950669777272],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956951111221415],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006954519897786528],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950444191868],
[445.9503141078548, 1015.069368764971, 1, 0, 0.3052322424780587, 0.002242402277483644, 0, -0.02899799473868619, 1, 0.3052322424780587, 0.0006956971936597703],
[446.2520221384517, 1014.776919342467, 1, 0, 0.3054368120087508, 0.002240886204185637, 0, -0.02897838938688981, 1, 0.3054368120087508, 0.0006954343406745334],
[446.8610098928123, 1014.768251293696, 0, 1, 0.3057280130873019, 0, 0.0009854466758544443, 0.01274346615173352, 0.6942719869126981, 1, 0.000695651569062421],
[444.8942989017827, 1013.310458398657, 1, 0, 0.305097275725126, 0.00224772491458868, 0, -0.0290668252979117, 1, 0.305097275725126, 0.0004720285939390746],
[445.1134555291475, 1013.091301771292, 1, 0, 0.3052475678060342, 0.002246618221889535, 0, -0.0290525139188209, 1, 0.3052475678060342, 0.000695683652503777],
[445.0290425867755, 1013.175714713664, 0, 1, 0.3051896795417494, 0, 0.0009869956271924781, 0.01276349667132485, 0.6948103204582506, 1, 0.0004698094712450637],
[444.8942989017827, 1013.200880084974, 1, 0, 0.3051202043003418, 0.00224772491458868, 0, -0.0290668252979117, 1, 0.3051202043003418, 0.0006957648210474881],
[445.0038772154651, 1013.066136399981, 0, 1, 0.3052006234680244, 0, 0.0009871023855891451, 0.01276487723513178, 0.6947993765319755, 1, 0.0006958715615242596],
[444.9209263559614, 1013.283830944478, 0, 1, 0.3051155361608059, 0, 0.0009868903158830669, 0.01276213482076534, 0.694884463839194, 1, 0.0006957452687313556],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956480560942812],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006951113873795655],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006954311979516176],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.000695261592287768],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006954344155906397],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006955544050848565],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006951231611344195],
[444.9925212128156, 1013.35623838071, 0, 1, 0.3051345011167597, 0, 0.0009868197995188226, 0.01276122292677563, 0.6948654988832403, 1, 0.001043896383444588],
[446.0209189491155, 1015.268251293696, 0, 2, 0.3052242691123233, 0, 0.001969922724808462, 0.02547438048168447, 0.4827133162305055, 1, 0.001043357532690564],
[445.003877215465, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002416017015058334],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0004538534141346499],
[445.6272636302588, 1012.358337042816, 0, 0, 0.3056458605795122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002676578154856731],
[446.4251487365443, 1014.619699507592, 0, 1, 0.3055519817020347, 0, 0.0009855909563803197, 0.01274533193914028, 0.6944480182979653, 1, 0.000427711756117211],
[446.0571321238226, 1012.147625176617, 0, 0, 0.3058947173849604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002404241246230404],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0004547811583459464],
[444.5493166854154, 1013.655440615024, 0, 0, 0.3048606956326252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002268132415303365],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004685120173486268],
[444.6775943728796, 1013.257675557574, 0, 0, 0.3050050324896053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002488278200351237],
[445.9503141078548, 1015.069368764971, 1, 0, 0.3052322424780587, 0.002242402277483644, 0, -0.02899799473868619, 1, 0.3052322424780587, 0.0004464723674278239],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0003505296987667884],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003059660544396722],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0003892867592350275],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006958521953753538],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0006955654210372796],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950762681064],
[445.0051481952832, 1013.261925173185, 1, 0, 0.3051602524134078, 0.002247165013832978, 0, -0.02905958484898286, 1, 0.3051602524134078, 0.00069540108983453],
[444.9245581772225, 1013.259564331742, 1, 0, 0.3051223445031628, 0.00224757204703832, 0, -0.02906484846598214, 1, 0.3051223445031628, 0.0006952427113473212],
[444.9535464728443, 1013.147625176617, 1, 0, 0.305159583658722, 0.002247425619881042, 0, -0.02906295491905749, 1, 0.305159583658722, 0.0006951263091283921],
[446.0882901578371, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053093464203278, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946906535796722, 1, 0.0006954050092928504],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0006956410583607071],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002273389177556127],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004680388009686207],
[446.7230338428299, 1015.026928212507, 0, 1, 0.3056083772457924, 0, 0.0009851955373844422, 0.01274021851320544, 0.6943916227542076, 1, 0.0006995041621943549],
[445.0038772154651, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002265770077917109],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.00046912679117201],
[445.0670527291373, 1013.137704571302, 0, 0, 0.3052157459375497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002267962364226389],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0004686576866856228],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0006958480627063846],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006957760489523687],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006952354357217172],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006955170762509055],
[446.2180735401726, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053873467648257, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946126532351743, 1, 0.0006956950648316948],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002242682796677079],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004709013980375168],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006955256089014762],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004238772779074586],
[446.2804198747516, 1014.999491759967, 0, 1, 0.3054037876805563, 0, 0.0009852221682062536, 0.01274056289406811, 0.6945962123194437, 1, 0.0006953766124110036],
[446.4251487365443, 1014.594534136281, 0, 1, 0.3055572446900452, 0, 0.0009856154023649402, 0.01274564806642062, 0.6944427553099548, 1, 0.0006952225219955485],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.000426409179445991],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002692237157431195],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004261204662640088],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.000695603609742577],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004752024857703368],
[446.2230338428299, 1014.956558086299, 0, 1, 0.3053854819130768, 0, 0.0009852638440856034, 0.0127411018325727, 0.6946145180869232, 1, 0.000695124046859146],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956036097845045],
[445.0038772154651, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3052182936580652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002177796428478124],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004775004017259894],
[445.0038772154651, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002177965966856071],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0004774857634633332],
[445.003877215465, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000283080604032502],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0004124152277002396],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956582379871872],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0006955837836153922],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006955840037919907],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006953655857355065],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006953830286116915],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0003743574321641049],
[446.1940455472082, 1015.08586608751, 1, 0, 0.3053446789999704, 0.002241177375582431, 0, -0.02898215471781062, 1, 0.3053446789999704, 0.0006951660188074652],
[444.9535464728443, 1013.251210827595, 0, 0, 0.3051379062132417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002850539495577386],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0004104410212298439],
[445.2230338428299, 1012.712236087624, 0, 1, 0.3053791502444878, 0, 0.0009874473363363965, 0.0127693380225892, 0.6946208497555122, 1, 0.0007002446130150969],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0006953572125017519],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006951907642528747],
[446.2481992141403, 1014.906227343678, 0, 1, 0.3054079644855951, 0, 0.0009853127048173778, 0.01274173368318093, 0.6945920355144048, 1, 0.0006952272410699654]
],
"NAMES": [
["Node1"],
["Node1311"],
["Node1308"],
["Node1305"],
["Node1302"],
["Node1299"],
["Node1296"],
["Node1293"],
["Node1287"],
["Node1284"],
["Node1281"],
["Node1278"],
["Node1275"],
["Node1269"],
["Node1266"],
["Node1263"],
["Node1257"],
["Node1254"],
["Node1251"],
["Node1248"],
["Node1245"],
["Node1242"],
["Node1236"],
["Node1233"],
["Node1230"],
["Node1227"],
["Node1224"],
["Node1221"],
["Node1218"],
["Node1215"],
["Node1212"],
["Node1209"],
["Node1206"],
["Node1203"],
["Node1199"],
["Node781"],
["Node773"],
["Node772"],
["Node768"],
["Node767"],
["Node763"],
["Node762"],
["Node758"],
["Node757"],
["Node753"],
["Node752"],
["Node747"],
["Node744"],
["Node739"],
["Node735"],
["Node734"],
["Node731"],
["Node728"],
["Node725"],
["Node722"],
["Node719"],
["Node716"],
["Node713"],
["Node710"],
["Node707"],
["Node703"],
["Node700"],
["Node697"],
["Node694"],
["Node660"],
["Node656"],
["Node649"],
["Node664"],
["Node670"],
["Node687"],
["Node590"],
["Node691"],
["Node789"],
["Node792"],
["Node803"],
["Node797"],
["Node800"],
["Node810"],
["Node809"],
["Node819"],
["Node818"],
["Node830"],
["Node829"],
["Node836"],
["Node835"],
["Node841"],
["Node840"],
["Node849"],
["Node848"],
["Node853"],
["Node876"],
["Node875"],
["Node866"],
["Node871"],
["Node549"],
["Node900"],
["Node897"],
["Node894"],
["Node886"],
["Node537"],
["Node541"],
["Node540"],
["Node522"],
["Node530"],
["Node529"],
["Node513"],
["Node512"],
["Node915"],
["Node922"],
["Node506"],
["Node492"],
["Node501"],
["Node480"],
["Node479"],
["Node1144"],
["Node1097"],
["Node1100"],
["Node1068"],
["Node948"],
["Node952"],
["Node951"],
["Node465"],
["Node458"],
["Node965"],
["Node451"],
["Node1023"],
["Node1022"],
["Node979"],
["Node978"],
["Node438"],
["Node437"],
["Node1007"],
["Node164"],
["Node214"],
["Node219"],
["Node370"],
["Node375"],
["Node403"],
["Node427"],
["Node426"],
["Node419"],
["Node414"],
["Node423"],
["Node1000"]
],
"RESOLVED": [
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0004758099013866916],
[446.2520221384517, 1014.902404419367, 1, 0, 0.3054105808581303, 0.002240886204185637, 0, -0.02897838938688981, 1, 0.3054105808581303, 0.0004730759851070409],
[446.2230338428299, 1014.906227343678, 0, 1, 0.305396001364366, 0, 0.0009853127048173778, 0.01274173368318093, 0.694603998635634, 1, 0.000475225423622616],
[446.2230338428299, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053897048162612, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946102951837388, 1, 0.000475131252077321],
[446.1940455472081, 1015.08586608751, 1, 0, 0.3053446789999704, 0.002241177375582432, 0, -0.02898215471781062, 1, 0.3053446789999703, 0.000475895280484179],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004757288074201536],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004753307064190939],
[446.3326121565124, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3054428294056018, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054428294056017, 0.0004764259189730885],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754019401135865],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754161868525478],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0004754161868525478],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004754304335915309],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004754304335915309],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004754446803305343],
[446.3861752641226, 1014.768251293696, 0, 1, 0.3055023939637355, 0, 0.0009854466758544443, 0.01274346615173352, 0.6944976060362645, 1, 0.000476543811264341],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760554375884685],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004760836536512185],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760836640075213],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004760836640075213],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0004760836640075213],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0004760836640075213],
[446.2180735401726, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053873467648257, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946126532351744, 1, 0.0004760836536512185],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.000476111881017976],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004761118910699319],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004762033351201196],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0004761236956743759],
[446.5598924215372, 1014.594534136281, 0, 1, 0.3056212843111601, 0, 0.00098561540236494, 0.01274564806642062, 0.6943787156888399, 1, 0.000476123695947954],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.000476111891074688],
[446.2230338428299, 1014.873197091549, 0, 1, 0.3054029052949291, 0, 0.000985344772988219, 0.01274214837801899, 0.6945970947050708, 1, 0.0004761236856575485],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.000476111881017976],
[446.3326121565124, 1014.853402158142, 1, 0, 0.3054591323650585, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054591323650585, 0.0004762315355500476],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004761401090296941],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004761401090228956],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004761401193807489],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004241906190125241],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006954936505963074],
[445.0038772154651, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3052182936580652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002771150515649534],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004181771271602641],
[445.4421904701948, 1012.762566830245, 0, 0, 0.3054730059273965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002814431903010537],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004136226133946554],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002891485113709387],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.000406119914684547],
[444.6196177816361, 1013.481553867825, 0, 0, 0.3049305675261648, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003025927315713989],
[445.921325812233, 1015.181307920097, 1, 0, 0.3051950735816172, 0.002242548050776734, 0, -0.02899987983005829, 1, 0.3051950735816171, 0.0003927522295836157],
[444.5493166854154, 1013.92492798501, 0, 0, 0.3048043654592415, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002503817961272746],
[445.8861752641226, 1015.402994978689, 0, 1, 0.3051320603368552, 0, 0.0009848306583151137, 0.01273550001936565, 0.6948679396631448, 1, 0.0004451758629018508],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006956950839707754],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956951273571549],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006956951137578796],
[444.9574744154548, 1013.247282884984, 1, 0, 0.3051405998970957, 0.002247405780324761, 0, -0.02906269836056465, 1, 0.3051405998970957, 0.0006958719830194357],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006956951237803904],
[446.4251487365443, 1014.619699507592, 0, 1, 0.3055519817020347, 0, 0.0009855909563803197, 0.01274533193914028, 0.6944480182979653, 1, 0.0006956951541558939],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950776391846],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950963060253],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950741842542],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956343247871664],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950832255069],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950669777272],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956951111221415],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006954519897786528],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0006956950444191868],
[445.9503141078548, 1015.069368764971, 1, 0, 0.3052322424780587, 0.002242402277483644, 0, -0.02899799473868619, 1, 0.3052322424780587, 0.0006956971936597703],
[446.2520221384517, 1014.776919342467, 1, 0, 0.3054368120087508, 0.002240886204185637, 0, -0.02897838938688981, 1, 0.3054368120087508, 0.0006954343406745334],
[446.8610098928123, 1014.768251293696, 0, 1, 0.3057280130873019, 0, 0.0009854466758544443, 0.01274346615173352, 0.6942719869126981, 1, 0.000695651569062421],
[444.8942989017827, 1013.310458398657, 1, 0, 0.305097275725126, 0.00224772491458868, 0, -0.0290668252979117, 1, 0.305097275725126, 0.0004720285939390746],
[445.1134555291475, 1013.091301771292, 1, 0, 0.3052475678060342, 0.002246618221889535, 0, -0.0290525139188209, 1, 0.3052475678060342, 0.000695683652503777],
[445.0290425867755, 1013.175714713664, 0, 1, 0.3051896795417494, 0, 0.0009869956271924781, 0.01276349667132485, 0.6948103204582506, 1, 0.0004698094712450637],
[444.8942989017827, 1013.200880084974, 1, 0, 0.3051202043003418, 0.00224772491458868, 0, -0.0290668252979117, 1, 0.3051202043003418, 0.0006957648210474881],
[445.0038772154651, 1013.066136399981, 0, 1, 0.3052006234680244, 0, 0.0009871023855891451, 0.01276487723513178, 0.6947993765319755, 1, 0.0006958715615242596],
[444.9209263559614, 1013.283830944478, 0, 1, 0.3051155361608059, 0, 0.0009868903158830669, 0.01276213482076534, 0.694884463839194, 1, 0.0006957452687313556],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956480560942812],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006951113873795655],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006954311979516176],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.000695261592287768],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006954344155906397],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0006955544050848565],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006951231611344195],
[444.9925212128156, 1013.35623838071, 0, 1, 0.3051345011167597, 0, 0.0009868197995188226, 0.01276122292677563, 0.6948654988832403, 1, 0.001043896383444588],
[446.0209189491155, 1015.268251293696, 0, 2, 0.3052242691123233, 0, 0.001969922724808462, 0.02547438048168447, 0.4827133162305055, 1, 0.001043357532690564],
[445.003877215465, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002416017015058334],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0004538534141346499],
[445.6272636302588, 1012.358337042816, 0, 0, 0.3056458605795122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002676578154856731],
[446.4251487365443, 1014.619699507592, 0, 1, 0.3055519817020347, 0, 0.0009855909563803197, 0.01274533193914028, 0.6944480182979653, 1, 0.000427711756117211],
[446.0571321238226, 1012.147625176617, 0, 0, 0.3058947173849604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002404241246230404],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0004547811583459464],
[444.5493166854154, 1013.655440615024, 0, 0, 0.3048606956326252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002268132415303365],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0004685120173486268],
[444.6775943728796, 1013.257675557574, 0, 0, 0.3050050324896053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002488278200351237],
[445.9503141078548, 1015.069368764971, 1, 0, 0.3052322424780587, 0.002242402277483644, 0, -0.02899799473868619, 1, 0.3052322424780587, 0.0004464723674278239],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0003505296987667884],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003059660544396722],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0003892867592350275],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006958521953753538],
[445.8861752641227, 1015.268251293696, 0, 1, 0.3051601987851068, 0, 0.0009849613624042311, 0.01273719024084223, 0.6948398012148932, 1, 0.0006955654210372796],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956950762681064],
[445.0051481952832, 1013.261925173185, 1, 0, 0.3051602524134078, 0.002247165013832978, 0, -0.02905958484898286, 1, 0.3051602524134078, 0.00069540108983453],
[444.9245581772225, 1013.259564331742, 1, 0, 0.3051223445031628, 0.00224757204703832, 0, -0.02906484846598214, 1, 0.3051223445031628, 0.0006952427113473212],
[444.9535464728443, 1013.147625176617, 1, 0, 0.305159583658722, 0.002247425619881042, 0, -0.02906295491905749, 1, 0.305159583658722, 0.0006951263091283921],
[446.0882901578371, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053093464203278, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946906535796722, 1, 0.0006954050092928504],
[446.1400829833262, 1015.014343574492, 0, 1, 0.3053339707797629, 0, 0.0009852077523144968, 0.01274037647258722, 0.6946660292202371, 1, 0.0006956410583607071],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002273389177556127],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004680388009686207],
[446.7230338428299, 1015.026928212507, 0, 1, 0.3056083772457924, 0, 0.0009851955373844422, 0.01274021851320544, 0.6943916227542076, 1, 0.0006995041621943549],
[445.0038772154651, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002265770077917109],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.00046912679117201],
[445.0670527291373, 1013.137704571302, 0, 0, 0.3052157459375497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002267962364226389],
[446.1450432859836, 1015.009383271835, 1, 0, 0.3053373655630707, 0.00224142353489959, 0, -0.02898533796760282, 1, 0.3053373655630707, 0.0004686576866856228],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0006958480627063846],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006957760489523687],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006952354357217172],
[446.6400829833262, 1014.514343574492, 0, 1, 0.3056761659583916, 0, 0.0009856933086590447, 0.01274665552450664, 0.6943238340416085, 1, 0.0006955170762509055],
[446.2180735401726, 1014.936353017646, 0, 1, 0.3053873467648257, 0, 0.0009852834584422594, 0.01274135547885946, 0.6946126532351743, 1, 0.0006956950648316948],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002242682796677079],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004709013980375168],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006955256089014762],
[446.3326121565124, 1014.821814401306, 1, 0, 0.3054657358893823, 0.002240481588760395, 0, -0.02897315703581249, 1, 0.3054657358893822, 0.0004238772779074586],
[446.2804198747516, 1014.999491759967, 0, 1, 0.3054037876805563, 0, 0.0009852221682062536, 0.01274056289406811, 0.6945962123194437, 1, 0.0006953766124110036],
[446.4251487365443, 1014.594534136281, 0, 1, 0.3055572446900452, 0, 0.0009856154023649402, 0.01274564806642062, 0.6944427553099548, 1, 0.0006952225219955485],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.000426409179445991],
[445.2230338428299, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3053227138464883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002692237157431195],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 0, 1, 0.3053907415481334, 0, 0.000985288273845736, 0.0127414177500434, 0.6946092584518666, 1, 0.0004261204662640088],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.000695603609742577],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0004752024857703368],
[446.2230338428299, 1014.956558086299, 0, 1, 0.3053854819130768, 0, 0.0009852638440856034, 0.0127411018325727, 0.6946145180869232, 1, 0.000695124046859146],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0006956036097845045],
[445.0038772154651, 1012.981723457609, 0, 0, 0.3052182936580652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002177796428478124],
[446.1134555291475, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053386458774901, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.30533864587749, 0.0004775004017259894],
[445.0038772154651, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002177965966856071],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068847, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068847, 0.0004774857634633332],
[445.003877215465, 1013.200880084974, 0, 0, 0.3051724217655801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000283080604032502],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0004124152277002396],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006956582379871872],
[446.1134555291475, 1015.040971028671, 1, 0, 0.3053157472068846, 0.002241582242377945, 0, -0.02898739031952403, 1, 0.3053157472068846, 0.0006955837836153922],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0006955840037919907],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006953655857355065],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0006953830286116915],
[446.2230338428299, 1014.931392714989, 1, 0, 0.3053907415481334, 0.00224103178042625, 0, -0.02898027193004532, 1, 0.3053907415481334, 0.0003743574321641049],
[446.1940455472082, 1015.08586608751, 1, 0, 0.3053446789999704, 0.002241177375582431, 0, -0.02898215471781062, 1, 0.3053446789999704, 0.0006951660188074652],
[444.9535464728443, 1013.251210827595, 0, 0, 0.3051379062132417, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002850539495577386],
[446.0882901578371, 1015.066136399981, 0, 1, 0.3052985242694231, 0, 0.0009851574829858724, 0.0127397264064766, 0.6947014757305769, 1, 0.0004104410212298439],
[445.2230338428299, 1012.712236087624, 0, 1, 0.3053791502444878, 0, 0.0009874473363363965, 0.0127693380225892, 0.6946208497555122, 1, 0.0007002446130150969],
[446.2230338428299, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054189064485529, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945810935514471, 1, 0.0006953572125017519],
[446.3577775278227, 1014.796649029996, 0, 1, 0.3054829588268438, 0, 0.0009854190994381591, 0.01274310954276001, 0.6945170411731562, 1, 0.0006951907642528747],
[446.2481992141403, 1014.906227343678, 0, 1, 0.3054079644855951, 0, 0.0009853127048173778, 0.01274173368318093, 0.6945920355144048, 1, 0.0006952272410699654]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6159179067103008, 2.133111939490159, 1, 0, 0.2240491886843588, 1.623592996899753, 0, -20.99576050854693, 1, 0.2240491886843587, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486834364929126, 2.051316563507088, 1, 0, 0.3162278121643041, 1.054092399564595, 0, -13.63116964497739, 1, 0.3162278121643041, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003751020767066472, 2.996248979232931, 0, 1, 0.001250340255688825, 0, 0.3337506351878707, 4.315951361800933, 0.9987496597443112, 1, 0.07732956356778899],
[0.999170920195189, 2.000829079804812, 0, 1, 0.3330569733983962, 0, 0.4997928159348592, 6.463153196212321, 0.6669430266016038, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9498955052831024, 2.050104494716898, 0, 1, 0.3166318350943674, 0, 0.4877800144221875, 6.30780767299414, 0.6833681649056327, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9893777529481542, 2.010622247051846, 1, 0, 0.3297925843160514, 1.010736290582837, 0, -13.07050297389563, 1, 0.3297925843160514, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486835661761208, 2, 1, 0, 0.3217312217079916, 1.054092255472203, 0, -13.63116778162287, 1, 0.3217312217079915, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7318963725821482, 2.268103627417851, 1, 0, 0.2439654575273829, 1.366313644200716, 0, -17.66871014347536, 1, 0.2439654575273829, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -6.465832431107511, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.999489308521825, 2.000510691478176, 0, 1, 0.3331631028406082, 0, 0.4998723597228569, 6.464181829820578, 0.6668368971593918, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311874644008436, 2.165421416766743, 1, 0, 0.2524287863489914, 1.367638326266205, 0, -17.68584048799525, 1, 0.2524287863489914, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486834365159181, 2.051316563484082, 1, 0, 0.3162278121719727, 1.054092399539033, 0, -13.63116964464684, 1, 0.3162278121719726, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7317239722362212, 2.268276027763777, 0, 1, 0.2439079907454072, 0, 0.4408634521372026, 5.701098413037478, 0.7560920092545927, 1, 0.07732956356778899],
[0.7314984346404306, 2.268501565359568, 1, 0, 0.2438328115468103, 1.367056924040517, 0, -17.6783219892625, 1, 0.2438328115468104, 0.07732956356778899],
[0.9483623577811302, 2.05163764221887, 1, 0, 0.3161207859270434, 1.054449274367749, 0, -13.63578463032955, 1, 0.3161207859270434, 0.07732956356778899],
[0.9979258659110435, 2.002074134088957, 0, 1, 0.3326419553036811, 0, 0.4994820036746789, 6.459133876228601, 0.667358044696319, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9371408318424403, 2.06285916815756, 2, 0, 0.3123802772808135, 2.134150953670383, 0, -27.59812489824198, 0.9999999999999999, 0.09758143763403804, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9994893388000992, 2.000510661199902, 0, 1, 0.3331631129333663, 0, 0.4998723672885613, 6.464181927657732, 0.6668368870666337, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.3399225786834813, 2.660077421316517, 0, 1, 0.1133075262278272, 0, 0.3759289079282073, 4.861386649346065, 0.8866924737721729, 1, 0.07732956356778899],
[1.3847512831185, 1.349523288619794, 0, 2, 0.5064419270220383, 0, 1.482004806338298, 19.16478947975875, 0.243599571401719, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486832139228144, 2.051316786077186, 1, 0, 0.3162277379742714, 1.05409264686469, 0, -13.63117284297934, 1, 0.3162277379742714, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.987974112701492, 2.012025887298508, 1, 0, 0.3293247042338307, 1.012172269641382, 0, -13.08907257382989, 1, 0.3293247042338308, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9482913271337498, 2, 1, 0, 0.3216409852060492, 1.054528256651405, 0, -13.63680600275184, 1, 0.3216409852060492, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.016898033149289, 0, 0, 0.2338872362997213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9994901162139449, 2.000509883786056, 0, 1, 0.3331633720713149, 0, 0.4998725615428875, 6.464184439689576, 0.6668366279286851, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[4.787892553391122, 9.334806918981485, 0, 0, 0.3390210605810448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01336057344784012],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6162566030220499, 2.133901652336005, 0, 1, 0.224080414943909, 0, 0.4686251584768629, 6.060103495425196, 0.7759195850560909, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.999845347320096, 0, 1, 0.3333505178503111, 0, 0.5000386661598887, 6.466332448928702, 0.6666494821496889, 1, 0.07732956356778899],
[1.001817090639828, 1.996971511801701, 0, 1, 0.33407392899392, 0, 0.5007582702558352, 6.475638127930959, 0.66592607100608, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311132768456334, 2.268886723154365, 1, 0, 0.2437044256152113, 1.367777103316288, 0, -17.6876351062975, 1, 0.2437044256152113, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9999694616275672, 2.000030538372433, 1, 1, 0.3333231538758556, 1.000030539305053, 0.4999923655234639, -6.466326081657552, 0.8888956750902527, 0.5555419828419639, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790345274, 2.001212220965473, 1, 1, 0.3329292596781758, 1.001213692228638, 0.4996971283323245, -6.48544412715677, 0.8891581080501416, 0.5550166274064935, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790321384, 2.001212220967862, 0, 1, 0.3329292596773794, 0, 0.4996971283317278, 6.461915796197157, 0.6670707403226206, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9979259889213685, 2.002074011078632, 0, 1, 0.3326419963071228, 0, 0.4994820343635761, 6.459134273087135, 0.6673580036928772, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7317238339251806, 2.268276166074818, 0, 1, 0.243907944641727, 0, 0.4408634252549897, 5.701098065405711, 0.756092055358273, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877789996122, 2.001212221000388, 0, 1, 0.3329292596665373, 0, 0.4996971283236062, 6.46191579609213, 0.6670707403334627, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.016898033149289, 0, 0, 0.2338872362997213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6913139502890363, 2.307557546875928, 1, 0, 0.2305246993552681, 1.446520787815584, 0, -18.70592204425838, 1, 0.2305246993552681, 0.07732956356778899],
[0.9483414197307019, 2.051658580269299, 1, 0, 0.3161138065769006, 1.054472555131007, 0, -13.63608568935774, 1, 0.3161138065769006, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.748851448800562, 2.000950647405104, 1, 0, 0.2723292159220731, 1.335378333849395, 0, -17.26866507760347, 1, 0.2723292159220732, 0.07732956356778899],
[0.00452287669761095, 1.769383058209058, 0, 1, 0.002549671100710824, 0, 0.565168743625354, 7.308572783162202, 0.9974503288992892, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9482825851843384, 2.051717414815662, 1, 0, 0.3160941950614461, 1.054537978049664, 0, -13.63693171661611, 1, 0.3160941950614462, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.9486835942703383, 2.051316405729662, 1, 0, 0.3162278647567794, 1.054092224256424, 0, -13.63116737795088, 1, 0.3162278647567793, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987878432237649, 2.001212156776236, 0, 1, 0.3329292810745882, 0, 0.4996971443601991, 6.461916003471975, 0.6670707189254118, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9969700180846992, 2.003029981915301, 0, 1, 0.3323233393615663, 0, 0.4992436503840038, 6.456051571354784, 0.6676766606384337, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9891492613679489, 2.010850738632051, 1, 0, 0.329716420455983, 1.010969768725344, 0, -13.07352223498718, 1, 0.329716420455983, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9959830335218849, 2.004016966478116, 0, 1, 0.3319943445072949, 0, 0.4989977713399365, 6.452871945960265, 0.6680056554927052, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6910532549569681, 2.308946745043031, 0, 0, 0.2303510849856561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268274841501644, 0, 1, 0.2436026683961872, 0, 0.4408636826999235, 5.701101394597314, 0.7563973316038128, 1, 0.07732956356778899],
[0.9915195417550509, 2.005220736693085, 0, 1, 0.3308660242884012, 0, 0.4986982139677813, 6.448998170416548, 0.6691339757115988, 1, 0.07732956356778899],
[0.6747225172159723, 1.957916082104306, 0, 1, 0.2562913562804173, 0, 0.5107471199303045, 6.604810584280242, 0.7437086437195828, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268274882447398, 0, 1, 0.2436026650700112, 0, 0.4408636747416746, 5.701101291683908, 0.7563973349299888, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.403447798197405, 1.329302516974983, 1, 0, 0.5135660548295911, 0.7125309550411528, 0, -9.214211514546189, 1, 0.5135660548295911, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486835661760613, 2.051316433823939, 1, 0, 0.3162278553920204, 1.054092255472269, 0, -13.63116778162372, 1, 0.3162278553920204, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003750574966576643, 2.996249425033421, 0, 1, 0.001250191655525549, 0, 0.3337505855303904, 4.315950719647041, 0.9987498083444745, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9491474826982469, 2.050852517301754, 1, 1, 0.3163824942327489, 1.053577044904749, 0.4876021028151115, -7.318998271514744, 0.8999021173430646, 0.5326671058085624, 0.07732956356778899],
[0.9985074700229915, 2.00149252997701, 0, 2, 0.332835823340997, 0, 0.9992542915076347, 12.92202160990685, 0.4451080386170853, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.001818325950031, 1.946865110504906, 0, 1, 0.3397510609529756, 0, 0.5136462688679324, 6.642301406727293, 0.6602489390470244, 1, 0.07732956356778899],
[0.9477065183867672, 2.052293481613233, 2, 0, 0.3159021727955891, 2.110357965464349, 0, -27.29044194869092, 1, 0.09979418277697416, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9473895047397817, 2, 2, 0, 0.3214334254825354, 2.111064129372362, 0, -27.29957382368712, 1, 0.1033194470174367, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9979261118837934, 2.002073888116207, 0, 1, 0.3326420372945977, 0, 0.4994820650405268, 6.45913466979118, 0.6673579627054023, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9982914325550638, 2.001708567444937, 0, 1, 0.3327638108516879, 0, 0.4995732227276427, 6.460313490450578, 0.6672361891483121, 1, 0.07732956356778899],
[0.999489308521825, 2.000510691478176, 0, 1, 0.3331631028406082, 0, 0.4998723597228569, 6.464181829820578, 0.6668368971593918, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.400109140606253, 1.33205175123821, 0, 1, 0.5124548648601177, 0, 0.7507215835048821, 9.708079922716506, 0.4875451351398823, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268658976212733, 0, 1, 0.2435714677004849, 0, 0.4407890346169991, 5.700136070606329, 0.7564285322995151, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.998788322765142, 2.001211677234858, 0, 1, 0.3329294409217139, 0, 0.4996972641003842, 6.46191755191192, 0.6670705590782861, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489945925467764, 2.051005407453224, 1, 0, 0.3163315308489254, 1.05374678407423, 0, -13.6267002612848, 1, 0.3163315308489254, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.328356905131667, 2.671643094868331, 0, 1, 0.1094523017105557, 0, 0.374301493309788, 4.840341468908798, 0.8905476982894442, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9900793946853363, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3300264648951121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489946325311276, 2.051005367468873, 1, 0, 0.3163315441770425, 1.053746739676317, 0, -13.62669968714587, 1, 0.3163315441770425, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.731724992071502, 2.268275007928497, 0, 1, 0.2439083306905008, 0, 0.4408636503530718, 5.70110097629867, 0.7560916693094992, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.000256691602053, 0, 2, 0.3219298632588277, 0, 0.9998716706695041, 12.93000535032106, 0.4597791103401921, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.132930965389597, 0, 1, 0.2240138769223533, 0, 0.4688384276034654, 6.062861420295876, 0.7759861230776467, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.945775716512817, 1.053555897291996, 1, 0, 0.6487364409980982, 0.5139338473152402, 0, -6.646020274829473, 1, 0.6487364409980982, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003749501840342878, 2.996250498159654, 0, 1, 0.00124983394678096, 0, 0.3337504659954888, 4.315949173861753, 0.9987501660532191, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.947215728023491, 1.051572047321564, 1, 0, 0.649334289019314, 0.5135537812315452, 0, -6.641105387609635, 1, 0.649334289019314, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7313422565932127, 2.268657743406786, 0, 1, 0.2437807521977377, 0, 0.4407892741451275, 5.700139168103812, 0.7562192478022622, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.946339582050545, 1.05201531249475, 2, 0, 0.6491358263130856, 1.027569915570911, 0, -13.2881897706576, 0.9999999999999998, 0.4213773210031726, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790381587, 2.001212220961842, 0, 1, 0.3329292596793861, 0, 0.499697128333231, 6.461915796216595, 0.6670707403206139, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6794563471850971, 1.375145975918674, 0, 1, 0.330699687985693, 0, 0.7271955250655805, 9.403848819450573, 0.6693003120143071, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311877398479911, 2, 1, 0, 0.2677178610536259, 1.367637811060526, 0, -17.68583382552807, 1, 0.2677178610536259, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987883531586592, 2.001211646841341, 0, 1, 0.3329294510528863, 0, 0.4996972716895652, 6.461917650052665, 0.6670705489471137, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.005045980117517244, 2.99495401988248, 0, 1, 0.001681993372505749, 0, 0.3338949424135865, 4.317817494481085, 0.9983180066274943, 1, 0.07732956356778899],
[0.7314980342406433, 2.268501965759355, 1, 0, 0.2438326780802146, 1.36705767232592, 0, -17.67833166583856, 1, 0.2438326780802146, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489955581782427, 2, 1, 0, 0.3218029798473109, 1.053745711855247, 0, -13.62668639570826, 1, 0.321802979847311, 0.07732956356778899],
[0.7487692514533839, 2.00138866216791, 1, 0, 0.272264093543427, 1.335524927150747, 0, -17.2705607730476, 1, 0.272264093543427, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311874244399876, 2.265160646604543, 1, 1, 0.2440261969248101, 1.367638401010376, 0.4414697922193694, -11.97690205478924, 0.9404512152144138, 0.4285036090640341, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.00251704741376, 1.94578757123947, 0, 1, 0.3400317053641846, 0, 0.5139307161690821, 6.645979783896723, 0.6599682946358154, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9999553746598384, 2.000044625340162, 0, 2, 0.333318458219946, 0, 0.999977687827763, 12.93137632868131, 0.4444642781502299, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9893778948595688, 2.010622105140431, 1, 0, 0.3297926316198563, 1.010736145607881, 0, -13.07050109912808, 1, 0.3297926316198563, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899]
],
"RESOLVED": [
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6159179067103008, 2.133111939490159, 1, 0, 0.2240491886843588, 1.623592996899753, 0, -20.99576050854693, 1, 0.2240491886843587, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486834364929126, 2.051316563507088, 1, 0, 0.3162278121643041, 1.054092399564595, 0, -13.63116964497739, 1, 0.3162278121643041, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003751020767066472, 2.996248979232931, 0, 1, 0.001250340255688825, 0, 0.3337506351878707, 4.315951361800933, 0.9987496597443112, 1, 0.07732956356778899],
[0.999170920195189, 2.000829079804812, 0, 1, 0.3330569733983962, 0, 0.4997928159348592, 6.463153196212321, 0.6669430266016038, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9498955052831024, 2.050104494716898, 0, 1, 0.3166318350943674, 0, 0.4877800144221875, 6.30780767299414, 0.6833681649056327, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9893777529481542, 2.010622247051846, 1, 0, 0.3297925843160514, 1.010736290582837, 0, -13.07050297389563, 1, 0.3297925843160514, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486835661761208, 2, 1, 0, 0.3217312217079916, 1.054092255472203, 0, -13.63116778162287, 1, 0.3217312217079915, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7318963725821482, 2.268103627417851, 1, 0, 0.2439654575273829, 1.366313644200716, 0, -17.66871014347536, 1, 0.2439654575273829, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -6.465832431107511, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.999489308521825, 2.000510691478176, 0, 1, 0.3331631028406082, 0, 0.4998723597228569, 6.464181829820578, 0.6668368971593918, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311874644008436, 2.165421416766743, 1, 0, 0.2524287863489914, 1.367638326266205, 0, -17.68584048799525, 1, 0.2524287863489914, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486834365159181, 2.051316563484082, 1, 0, 0.3162278121719727, 1.054092399539033, 0, -13.63116964464684, 1, 0.3162278121719726, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7317239722362212, 2.268276027763777, 0, 1, 0.2439079907454072, 0, 0.4408634521372026, 5.701098413037478, 0.7560920092545927, 1, 0.07732956356778899],
[0.7314984346404306, 2.268501565359568, 1, 0, 0.2438328115468103, 1.367056924040517, 0, -17.6783219892625, 1, 0.2438328115468104, 0.07732956356778899],
[0.9483623577811302, 2.05163764221887, 1, 0, 0.3161207859270434, 1.054449274367749, 0, -13.63578463032955, 1, 0.3161207859270434, 0.07732956356778899],
[0.9979258659110435, 2.002074134088957, 0, 1, 0.3326419553036811, 0, 0.4994820036746789, 6.459133876228601, 0.667358044696319, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9371408318424403, 2.06285916815756, 2, 0, 0.3123802772808135, 2.134150953670383, 0, -27.59812489824198, 0.9999999999999999, 0.09758143763403804, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9994893388000992, 2.000510661199902, 0, 1, 0.3331631129333663, 0, 0.4998723672885613, 6.464181927657732, 0.6668368870666337, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.3399225786834813, 2.660077421316517, 0, 1, 0.1133075262278272, 0, 0.3759289079282073, 4.861386649346065, 0.8866924737721729, 1, 0.07732956356778899],
[1.3847512831185, 1.349523288619794, 0, 2, 0.5064419270220383, 0, 1.482004806338298, 19.16478947975875, 0.243599571401719, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486832139228144, 2.051316786077186, 1, 0, 0.3162277379742714, 1.05409264686469, 0, -13.63117284297934, 1, 0.3162277379742714, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.987974112701492, 2.012025887298508, 1, 0, 0.3293247042338307, 1.012172269641382, 0, -13.08907257382989, 1, 0.3293247042338308, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9482913271337498, 2, 1, 0, 0.3216409852060492, 1.054528256651405, 0, -13.63680600275184, 1, 0.3216409852060492, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.016898033149289, 0, 0, 0.2338872362997213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9994901162139449, 2.000509883786056, 0, 1, 0.3331633720713149, 0, 0.4998725615428875, 6.464184439689576, 0.6668366279286851, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[4.787892553391122, 9.334806918981485, 0, 0, 0.3390210605810448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01336057344784012],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6162566030220499, 2.133901652336005, 0, 1, 0.224080414943909, 0, 0.4686251584768629, 6.060103495425196, 0.7759195850560909, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.999845347320096, 0, 1, 0.3333505178503111, 0, 0.5000386661598887, 6.466332448928702, 0.6666494821496889, 1, 0.07732956356778899],
[1.001817090639828, 1.996971511801701, 0, 1, 0.33407392899392, 0, 0.5007582702558352, 6.475638127930959, 0.66592607100608, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311132768456334, 2.268886723154365, 1, 0, 0.2437044256152113, 1.367777103316288, 0, -17.6876351062975, 1, 0.2437044256152113, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9999694616275672, 2.000030538372433, 1, 1, 0.3333231538758556, 1.000030539305053, 0.4999923655234639, -6.466326081657552, 0.8888956750902527, 0.5555419828419639, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790345274, 2.001212220965473, 1, 1, 0.3329292596781758, 1.001213692228638, 0.4996971283323245, -6.48544412715677, 0.8891581080501416, 0.5550166274064935, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790321384, 2.001212220967862, 0, 1, 0.3329292596773794, 0, 0.4996971283317278, 6.461915796197157, 0.6670707403226206, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9979259889213685, 2.002074011078632, 0, 1, 0.3326419963071228, 0, 0.4994820343635761, 6.459134273087135, 0.6673580036928772, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7317238339251806, 2.268276166074818, 0, 1, 0.243907944641727, 0, 0.4408634252549897, 5.701098065405711, 0.756092055358273, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877789996122, 2.001212221000388, 0, 1, 0.3329292596665373, 0, 0.4996971283236062, 6.46191579609213, 0.6670707403334627, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.016898033149289, 0, 0, 0.2338872362997213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6913139502890363, 2.307557546875928, 1, 0, 0.2305246993552681, 1.446520787815584, 0, -18.70592204425838, 1, 0.2305246993552681, 0.07732956356778899],
[0.9483414197307019, 2.051658580269299, 1, 0, 0.3161138065769006, 1.054472555131007, 0, -13.63608568935774, 1, 0.3161138065769006, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.748851448800562, 2.000950647405104, 1, 0, 0.2723292159220731, 1.335378333849395, 0, -17.26866507760347, 1, 0.2723292159220732, 0.07732956356778899],
[0.00452287669761095, 1.769383058209058, 0, 1, 0.002549671100710824, 0, 0.565168743625354, 7.308572783162202, 0.9974503288992892, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9482825851843384, 2.051717414815662, 1, 0, 0.3160941950614461, 1.054537978049664, 0, -13.63693171661611, 1, 0.3160941950614462, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.9486835942703383, 2.051316405729662, 1, 0, 0.3162278647567794, 1.054092224256424, 0, -13.63116737795088, 1, 0.3162278647567793, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987878432237649, 2.001212156776236, 0, 1, 0.3329292810745882, 0, 0.4996971443601991, 6.461916003471975, 0.6670707189254118, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9969700180846992, 2.003029981915301, 0, 1, 0.3323233393615663, 0, 0.4992436503840038, 6.456051571354784, 0.6676766606384337, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.3262828425855198, 2.673717157414479, 0, 0, 0.1087609475285067, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9891492613679489, 2.010850738632051, 1, 0, 0.329716420455983, 1.010969768725344, 0, -13.07352223498718, 1, 0.329716420455983, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9959830335218849, 2.004016966478116, 0, 1, 0.3319943445072949, 0, 0.4989977713399365, 6.452871945960265, 0.6680056554927052, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6910532549569681, 2.308946745043031, 0, 0, 0.2303510849856561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268274841501644, 0, 1, 0.2436026683961872, 0, 0.4408636826999235, 5.701101394597314, 0.7563973316038128, 1, 0.07732956356778899],
[0.9915195417550509, 2.005220736693085, 0, 1, 0.3308660242884012, 0, 0.4986982139677813, 6.448998170416548, 0.6691339757115988, 1, 0.07732956356778899],
[0.6747225172159723, 1.957916082104306, 0, 1, 0.2562913562804173, 0, 0.5107471199303045, 6.604810584280242, 0.7437086437195828, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268274882447398, 0, 1, 0.2436026650700112, 0, 0.4408636747416746, 5.701101291683908, 0.7563973349299888, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.403447798197405, 1.329302516974983, 1, 0, 0.5135660548295911, 0.7125309550411528, 0, -9.214211514546189, 1, 0.5135660548295911, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9486835661760613, 2.051316433823939, 1, 0, 0.3162278553920204, 1.054092255472269, 0, -13.63116778162372, 1, 0.3162278553920204, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003750574966576643, 2.996249425033421, 0, 1, 0.001250191655525549, 0, 0.3337505855303904, 4.315950719647041, 0.9987498083444745, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9491474826982469, 2.050852517301754, 1, 1, 0.3163824942327489, 1.053577044904749, 0.4876021028151115, -7.318998271514744, 0.8999021173430646, 0.5326671058085624, 0.07732956356778899],
[0.9985074700229915, 2.00149252997701, 0, 2, 0.332835823340997, 0, 0.9992542915076347, 12.92202160990685, 0.4451080386170853, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.001818325950031, 1.946865110504906, 0, 1, 0.3397510609529756, 0, 0.5136462688679324, 6.642301406727293, 0.6602489390470244, 1, 0.07732956356778899],
[0.9477065183867672, 2.052293481613233, 2, 0, 0.3159021727955891, 2.110357965464349, 0, -27.29044194869092, 1, 0.09979418277697416, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9473895047397817, 2, 2, 0, 0.3214334254825354, 2.111064129372362, 0, -27.29957382368712, 1, 0.1033194470174367, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9979261118837934, 2.002073888116207, 0, 1, 0.3326420372945977, 0, 0.4994820650405268, 6.45913466979118, 0.6673579627054023, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9982914325550638, 2.001708567444937, 0, 1, 0.3327638108516879, 0, 0.4995732227276427, 6.460313490450578, 0.6672361891483121, 1, 0.07732956356778899],
[0.999489308521825, 2.000510691478176, 0, 1, 0.3331631028406082, 0, 0.4998723597228569, 6.464181829820578, 0.6668368971593918, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.400109140606253, 1.33205175123821, 0, 1, 0.5124548648601177, 0, 0.7507215835048821, 9.708079922716506, 0.4875451351398823, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.268658976212733, 0, 1, 0.2435714677004849, 0, 0.4407890346169991, 5.700136070606329, 0.7564285322995151, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.998788322765142, 2.001211677234858, 0, 1, 0.3329294409217139, 0, 0.4996972641003842, 6.46191755191192, 0.6670705590782861, 1, 0.07732956356778899],
[0, 2.999999999999998, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489945925467764, 2.051005407453224, 1, 0, 0.3163315308489254, 1.05374678407423, 0, -13.6267002612848, 1, 0.3163315308489254, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.328356905131667, 2.671643094868331, 0, 1, 0.1094523017105557, 0, 0.374301493309788, 4.840341468908798, 0.8905476982894442, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9900793946853363, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3300264648951121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.8340982809926675, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2780327603308893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0, 1.768518867658021, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489946325311276, 2.051005367468873, 1, 0, 0.3163315441770425, 1.053746739676317, 0, -13.62669968714587, 1, 0.3163315441770425, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.731724992071502, 2.268275007928497, 0, 1, 0.2439083306905008, 0, 0.4408636503530718, 5.70110097629867, 0.7560916693094992, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.000256691602053, 0, 2, 0.3219298632588277, 0, 0.9998716706695041, 12.93000535032106, 0.4597791103401921, 1, 0.07732956356778899],
[1.949669257379202, 1.050330742620796, 0, 0, 0.6498897524597343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.132930965389597, 0, 1, 0.2240138769223533, 0, 0.4688384276034654, 6.062861420295876, 0.7759861230776467, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.945775716512817, 1.053555897291996, 1, 0, 0.6487364409980982, 0.5139338473152402, 0, -6.646020274829473, 1, 0.6487364409980982, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.009920605314663, 0, 0, 0.3208786694906433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 2.075312688785978, 0, 0, 0.2450745154133744, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.003749501840342878, 2.996250498159654, 0, 1, 0.00124983394678096, 0, 0.3337504659954888, 4.315949173861753, 0.9987501660532191, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.947215728023491, 1.051572047321564, 1, 0, 0.649334289019314, 0.5135537812315452, 0, -6.641105387609635, 1, 0.649334289019314, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7313422565932127, 2.268657743406786, 0, 1, 0.2437807521977377, 0, 0.4407892741451275, 5.700139168103812, 0.7562192478022622, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.946339582050545, 1.05201531249475, 2, 0, 0.6491358263130856, 1.027569915570911, 0, -13.2881897706576, 0.9999999999999998, 0.4213773210031726, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987877790381587, 2.001212220961842, 0, 1, 0.3329292596793861, 0, 0.499697128333231, 6.461915796216595, 0.6670707403206139, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6794563471850971, 1.375145975918674, 0, 1, 0.330699687985693, 0, 0.7271955250655805, 9.403848819450573, 0.6693003120143071, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311877398479911, 2, 1, 0, 0.2677178610536259, 1.367637811060526, 0, -17.68583382552807, 1, 0.2677178610536259, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7490298462004591, 2, 0, 0, 0.2724706125820068, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.404229787428833, 1.32628284258552, 0, 0, 0.5142733170296493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.9987883531586592, 2.001211646841341, 0, 1, 0.3329294510528863, 0, 0.4996972716895652, 6.461917650052665, 0.6670705489471137, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2, 0, 0, 0.2675368068194989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 1.632638599320278, 0, 0, 0.3798470478470499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.005045980117517244, 2.99495401988248, 0, 1, 0.001681993372505749, 0, 0.3338949424135865, 4.317817494481085, 0.9983180066274943, 1, 0.07732956356778899],
[0.7314980342406433, 2.268501965759355, 1, 0, 0.2438326780802146, 1.36705767232592, 0, -17.67833166583856, 1, 0.2438326780802146, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9489955581782427, 2, 1, 0, 0.3218029798473109, 1.053745711855247, 0, -13.62668639570826, 1, 0.321802979847311, 0.07732956356778899],
[0.7487692514533839, 2.00138866216791, 1, 0, 0.272264093543427, 1.335524927150747, 0, -17.2705607730476, 1, 0.272264093543427, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.958921441905798, 0, 0, 0.2559094733277967, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.165901719007331, 0, 0, 0.2522127506587915, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7311874244399876, 2.265160646604543, 1, 1, 0.2440261969248101, 1.367638401010376, 0.4414697922193694, -11.97690205478924, 0.9404512152144138, 0.4285036090640341, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 6.465832431107511, 0.6666666666666667, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 2.133289280029471, 0, 0, 0.223984678457394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2.050330742620797, 0, 0, 0.3165564191264011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.00251704741376, 1.94578757123947, 0, 1, 0.3400317053641846, 0, 0.5139307161690821, 6.645979783896723, 0.6599682946358154, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.7305126300143516, 2.269487369985647, 0, 0, 0.243504210004784, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9496692573792035, 2, 0, 0, 0.3219578788379106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6737171574144808, 1.376613585206315, 0, 0, 0.3285895018836398, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9999553746598384, 2.000044625340162, 0, 2, 0.333318458219946, 0, 0.999977687827763, 12.93137632868131, 0.4444642781502299, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.9893778948595688, 2.010622105140431, 1, 0, 0.3297926316198563, 1.010736145607881, 0, -13.07050109912808, 1, 0.3297926316198563, 0.07732956356778899],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -12.93166486221502, 1, 0.3333333333333333, 0.07732956356778899],
[1, 1.949669257379202, 0, 0, 0.3390210605810449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[1.346253196185341, 1.550161152836343, 0, 0, 0.4647999332830478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899],
[0.6157405661709894, 1.434590176449807, 0, 0, 0.3003127999651075, 0, 0, 0, 1, 1, 0.07732956356778899]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0004758099013866916,
"Nucleotide GTR":0.000456295408184113,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1000":{
"Global MG94xREV":0.0006952272410699654,
"Nucleotide GTR":0.0006667137376086725,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.0006956582379871872,
"Nucleotide GTR":0.0006671270579571912,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1022":{
"Global MG94xREV":0.0004775004017259894,
"Nucleotide GTR":0.0004579165756716061,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1023":{
"Global MG94xREV":0.0002177796428478124,
"Nucleotide GTR":0.0002088477997995111,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1068":{
"Global MG94xREV":0.0006952225219955485,
"Nucleotide GTR":0.000666709212078663,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "TTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1097":{
"Global MG94xREV":0.0004238772779074586,
"Nucleotide GTR":0.0004064927084936115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1100":{
"Global MG94xREV":0.0006953766124110036,
"Nucleotide GTR":0.0006668569827509686,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1144":{
"Global MG94xREV":0.0006955256089014762,
"Nucleotide GTR":0.0006669998684165248,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1199":{
"Global MG94xREV":0.0004241906190125241,
"Nucleotide GTR":0.0004067931984729503,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1203":{
"Global MG94xREV":0.0004761401193807489,
"Nucleotide GTR":0.0004566120828769876,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1206":{
"Global MG94xREV":0.0004761401090228956,
"Nucleotide GTR":0.0004566120729439431,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1209":{
"Global MG94xREV":0.0004761401090296941,
"Nucleotide GTR":0.0004566120729504626,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1212":{
"Global MG94xREV":0.0004762315355500476,
"Nucleotide GTR":0.0004566997497753921,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1215":{
"Global MG94xREV":0.000476111881017976,
"Nucleotide GTR":0.0004565850026602234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1218":{
"Global MG94xREV":0.0004761236856575485,
"Nucleotide GTR":0.0004565963231535897,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1221":{
"Global MG94xREV":0.000476111891074688,
"Nucleotide GTR":0.000456585012304477,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1224":{
"Global MG94xREV":0.000476123695947954,
"Nucleotide GTR":0.0004565963330219524,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1227":{
"Global MG94xREV":0.0004761236956743759,
"Nucleotide GTR":0.0004565963327595946,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1230":{
"Global MG94xREV":0.0004762033351201196,
"Nucleotide GTR":0.0004566727059357247,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1233":{
"Global MG94xREV":0.0004761118910699319,
"Nucleotide GTR":0.0004565850122999163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1236":{
"Global MG94xREV":0.000476111881017976,
"Nucleotide GTR":0.0004565850026602234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1242":{
"Global MG94xREV":0.0004760836536512185,
"Nucleotide GTR":0.0004565579329884931,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1245":{
"Global MG94xREV":0.0004760836640075213,
"Nucleotide GTR":0.0004565579429200508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1248":{
"Global MG94xREV":0.0004760836640075213,
"Nucleotide GTR":0.0004565579429200508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "I", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ATT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1251":{
"Global MG94xREV":0.0004760836640075213,
"Nucleotide GTR":0.0004565579429200508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1254":{
"Global MG94xREV":0.0004760836640075213,
"Nucleotide GTR":0.0004565579429200508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1257":{
"Global MG94xREV":0.0004760836536512185,
"Nucleotide GTR":0.0004565579329884931,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1263":{
"Global MG94xREV":0.0004760554375884685,
"Nucleotide GTR":0.0004565308741571569,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "I", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ATT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1266":{
"Global MG94xREV":0.000476543811264341,
"Nucleotide GTR":0.0004569992180590583,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1269":{
"Global MG94xREV":0.0004754446803305343,
"Nucleotide GTR":0.0004559451660172078,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1275":{
"Global MG94xREV":0.0004754304335915309,
"Nucleotide GTR":0.0004559315035827564,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1278":{
"Global MG94xREV":0.0004754304335915309,
"Nucleotide GTR":0.0004559315035827564,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1281":{
"Global MG94xREV":0.0004754161868525478,
"Nucleotide GTR":0.0004559178411483251,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1284":{
"Global MG94xREV":0.0004754161868525478,
"Nucleotide GTR":0.0004559178411483251,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "S", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "TCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1287":{
"Global MG94xREV":0.0004754019401135865,
"Nucleotide GTR":0.0004559041787139139,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1293":{
"Global MG94xREV":0.0004764259189730885,
"Nucleotide GTR":0.000456886160909549,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1296":{
"Global MG94xREV":0.0004753307064190939,
"Nucleotide GTR":0.0004558358665421627,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1299":{
"Global MG94xREV":0.0004757288074201536,
"Nucleotide GTR":0.0004562176401417609,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1302":{
"Global MG94xREV":0.000475895280484179,
"Nucleotide GTR":0.0004563772856104239,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1305":{
"Global MG94xREV":0.000475131252077321,
"Nucleotide GTR":0.0004556445924639472,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1308":{
"Global MG94xREV":0.000475225423622616,
"Nucleotide GTR":0.0004557349017315233,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1311":{
"Global MG94xREV":0.0004730759851070409,
"Nucleotide GTR":0.0004536736185972876,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node164":{
"Global MG94xREV":0.0006955837836153922,
"Nucleotide GTR":0.0006670556571984625,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node214":{
"Global MG94xREV":0.0006955840037919907,
"Nucleotide GTR":0.000667055868344911,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACT", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":0.0006953655857355065,
"Nucleotide GTR":0.0006668464083148705,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "F", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "TTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node370":{
"Global MG94xREV":0.0006953830286116915,
"Nucleotide GTR":0.0006668631358026451,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"Global MG94xREV":0.0003743574321641049,
"Nucleotide GTR":0.0003590038307699129,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node403":{
"Global MG94xREV":0.0006951660188074652,
"Nucleotide GTR":0.0006666550262679123,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0006953572125017519,
"Nucleotide GTR":0.0006668383784943412,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node419":{
"Global MG94xREV":0.0007002446130150969,
"Nucleotide GTR":0.0006715253310056211,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0006951907642528747,
"Nucleotide GTR":0.0006666787568230788,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.0004104410212298439,
"Nucleotide GTR":0.0003936075158834728,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node427":{
"Global MG94xREV":0.0002850539495577386,
"Nucleotide GTR":0.000273362970986673,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.0004124152277002396,
"Nucleotide GTR":0.0003955007538018591,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node438":{
"Global MG94xREV":0.000283080604032502,
"Nucleotide GTR":0.0002714705587033181,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node451":{
"Global MG94xREV":0.0006956036097845045,
"Nucleotide GTR":0.0006670746702326632,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0004752024857703368,
"Nucleotide GTR":0.0004557129046342833,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.000695603609742577,
"Nucleotide GTR":0.0006670746701924553,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.0004709013980375168,
"Nucleotide GTR":0.000451588218332121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node480":{
"Global MG94xREV":0.0002242682796677079,
"Nucleotide GTR":0.0002150703167703939,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node492":{
"Global MG94xREV":0.0006955170762509055,
"Nucleotide GTR":0.000666991685717376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node501":{
"Global MG94xREV":0.0006956950648316948,
"Nucleotide GTR":0.0006671623744144519,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.0006952354357217172,
"Nucleotide GTR":0.0006667215961714195,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.0004686576866856228,
"Nucleotide GTR":0.0004494365287935555,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node513":{
"Global MG94xREV":0.0002267962364226389,
"Nucleotide GTR":0.0002174945938945171,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0006995041621943549,
"Nucleotide GTR":0.0006708152484526814,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.00046912679117201,
"Nucleotide GTR":0.0004498863937973579,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node530":{
"Global MG94xREV":0.0002265770077917109,
"Nucleotide GTR":0.0002172843565342951,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node537":{
"Global MG94xREV":0.0006956410583607071,
"Nucleotide GTR":0.0006671105829224044,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.0004680388009686207,
"Nucleotide GTR":0.0004488430255687683,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node541":{
"Global MG94xREV":0.0002273389177556127,
"Nucleotide GTR":0.000218015018121969,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.0006956950762681064,
"Nucleotide GTR":0.0006671623853818193,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":0.0006956480560942812,
"Nucleotide GTR":0.0006671172936564347,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node649":{
"Global MG94xREV":0.0004698094712450637,
"Nucleotide GTR":0.0004505410749666355,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.000695683652503777,
"Nucleotide GTR":0.0006671514301427783,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node660":{
"Global MG94xREV":0.0004720285939390746,
"Nucleotide GTR":0.0004526691843072002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node664":{
"Global MG94xREV":0.0006957648210474881,
"Nucleotide GTR":0.0006672292697036548,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.0006958715615242596,
"Nucleotide GTR":0.0006673316324104334,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node687":{
"Global MG94xREV":0.0006957452687313556,
"Nucleotide GTR":0.0006672105192908439,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.0006951113873795655,
"Nucleotide GTR":0.0006666026354504428,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node694":{
"Global MG94xREV":0.000695651569062421,
"Nucleotide GTR":0.0006671206625464618,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node697":{
"Global MG94xREV":0.0006954343406745334,
"Nucleotide GTR":0.000666912343392884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node700":{
"Global MG94xREV":0.0006956971936597703,
"Nucleotide GTR":0.0006671644159324465,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.0006956950444191868,
"Nucleotide GTR":0.0006671623548391263,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node707":{
"Global MG94xREV":0.0006954519897786528,
"Nucleotide GTR":0.0006669292686505232,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node710":{
"Global MG94xREV":0.0006956951111221415,
"Nucleotide GTR":0.0006671624188063781,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node713":{
"Global MG94xREV":0.0006956950669777272,
"Nucleotide GTR":0.0006671623764724687,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node716":{
"Global MG94xREV":0.0006956950832255069,
"Nucleotide GTR":0.0006671623920538744,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node719":{
"Global MG94xREV":0.0006956343247871664,
"Nucleotide GTR":0.0006671041255143548,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node722":{
"Global MG94xREV":0.0006956950741842542,
"Nucleotide GTR":0.0006671623833834324,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":0.0006956950963060253,
"Nucleotide GTR":0.0006671624045979184,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node728":{
"Global MG94xREV":0.0006956950776391846,
"Nucleotide GTR":0.0006671623866966654,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.0006956951541558939,
"Nucleotide GTR":0.0006671624600751782,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"Global MG94xREV":0.0006956951237803904,
"Nucleotide GTR":0.0006671624309454722,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node735":{
"Global MG94xREV":0.0006958719830194357,
"Nucleotide GTR":0.0006673320366187379,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node739":{
"Global MG94xREV":0.0006956951137578796,
"Nucleotide GTR":0.000667162421334016,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node744":{
"Global MG94xREV":0.0006956951273571549,
"Nucleotide GTR":0.0006671624343755416,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node747":{
"Global MG94xREV":0.0006956950839707754,
"Nucleotide GTR":0.0006671623927685767,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node752":{
"Global MG94xREV":0.0004451758629018508,
"Nucleotide GTR":0.0004269177700684905,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node753":{
"Global MG94xREV":0.0002503817961272746,
"Nucleotide GTR":0.0002401128339969466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node757":{
"Global MG94xREV":0.0003927522295836157,
"Nucleotide GTR":0.0003766441984304808,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node758":{
"Global MG94xREV":0.0003025927315713989,
"Nucleotide GTR":0.0002901824311842264,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.000406119914684547,
"Nucleotide GTR":0.0003894636318046695,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.0002891485113709387,
"Nucleotide GTR":0.000277289601660907,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node767":{
"Global MG94xREV":0.0004136226133946554,
"Nucleotide GTR":0.0003966586207286795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node768":{
"Global MG94xREV":0.0002814431903010537,
"Nucleotide GTR":0.000269900300571278,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node772":{
"Global MG94xREV":0.0004181771271602641,
"Nucleotide GTR":0.0004010263392475704,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node773":{
"Global MG94xREV":0.0002771150515649534,
"Nucleotide GTR":0.0002657496727144162,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node781":{
"Global MG94xREV":0.0006954936505963074,
"Nucleotide GTR":0.0006669692208241583,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node789":{
"Global MG94xREV":0.0006954311979516176,
"Nucleotide GTR":0.0006669093295631359,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node792":{
"Global MG94xREV":0.000695261592287768,
"Nucleotide GTR":0.000666746679972635,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node797":{
"Global MG94xREV":0.0006955544050848565,
"Nucleotide GTR":0.0006670274835758799,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node800":{
"Global MG94xREV":0.0006951231611344195,
"Nucleotide GTR":0.0006666139263257721,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node802":{
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "S", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "TCA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node803":{
"Global MG94xREV":0.0006954344155906397,
"Nucleotide GTR":0.0006669124152364418,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node809":{
"Global MG94xREV":0.001043357532690564,
"Nucleotide GTR":0.001000566087156937,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "I", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "ATA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node810":{
"Global MG94xREV":0.001043896383444588,
"Nucleotide GTR":0.001001082837909794,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node818":{
"Global MG94xREV":0.0004538534141346499,
"Nucleotide GTR":0.0004352394270375215,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node819":{
"Global MG94xREV":0.0002416017015058334,
"Nucleotide GTR":0.0002316928392731928,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node829":{
"Global MG94xREV":0.000427711756117211,
"Nucleotide GTR":0.0004101699224288257,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node830":{
"Global MG94xREV":0.0002676578154856731,
"Nucleotide GTR":0.0002566803082801908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node835":{
"Global MG94xREV":0.0004547811583459464,
"Nucleotide GTR":0.0004361291214771502,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node836":{
"Global MG94xREV":0.0002404241246230404,
"Nucleotide GTR":0.000230563558602832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node840":{
"Global MG94xREV":0.0004685120173486268,
"Nucleotide GTR":0.0004492968338242185,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0002268132415303365,
"Nucleotide GTR":0.0002175109015680972,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node848":{
"Global MG94xREV":0.0004464723674278239,
"Nucleotide GTR":0.000428161100777177,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node849":{
"Global MG94xREV":0.0002488278200351237,
"Nucleotide GTR":0.0002386225914584669,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node853":{
"Global MG94xREV":0.0003505296987667884,
"Nucleotide GTR":0.0003361533492962315,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node866":{
"Global MG94xREV":0.0006958521953753538,
"Nucleotide GTR":0.0006673130605295324,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node871":{
"Global MG94xREV":0.0006955654210372796,
"Nucleotide GTR":0.0006670380477286908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node875":{
"Global MG94xREV":0.0003892867592350275,
"Nucleotide GTR":0.0003733208581581352,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node876":{
"Global MG94xREV":0.0003059660544396722,
"Nucleotide GTR":0.0002934174032405657,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node886":{
"Global MG94xREV":0.0006954050092928504,
"Nucleotide GTR":0.0006668842149854289,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node894":{
"Global MG94xREV":0.0006951263091283921,
"Nucleotide GTR":0.0006666169452103945,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node897":{
"Global MG94xREV":0.0006952427113473212,
"Nucleotide GTR":0.0006667285734002352,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node900":{
"Global MG94xREV":0.00069540108983453,
"Nucleotide GTR":0.0006668804562766908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node915":{
"Global MG94xREV":0.0006958480627063846,
"Nucleotide GTR":0.0006673090973545993,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node922":{
"Global MG94xREV":0.0006957760489523687,
"Nucleotide GTR":0.0006672400371160719,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node948":{
"Global MG94xREV":0.000426409179445991,
"Nucleotide GTR":0.0004089207686130829,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node951":{
"Global MG94xREV":0.0004261204662640088,
"Nucleotide GTR":0.0004086438964865537,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node952":{
"Global MG94xREV":0.0002692237157431195,
"Nucleotide GTR":0.000258181985935626,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node965":{
"Global MG94xREV":0.000695124046859146,
"Nucleotide GTR":0.0006666147757240807,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node978":{
"Global MG94xREV":0.0004774857634633332,
"Nucleotide GTR":0.0004579025377711453,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node979":{
"Global MG94xREV":0.0002177965966856071,
"Nucleotide GTR":0.0002088640583059321,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629021550114553,
"Nucleotide GTR":0.0006672991166882155,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "I", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "ATT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628422051773733,
"Nucleotide GTR":0.0006672387692130619,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAG", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002088910945272164,
"Nucleotide GTR":0.0002102766476292982,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005038497954562404,
"Nucleotide GTR":0.005071917792237036,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "E", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "S", "M", "L", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "N", "E", "T", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "-", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTA", "TTC", "TGT", "GAA", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TCG", "ATG", "CTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAT", "GAA", "ACG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "---", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629918359208191,
"Nucleotide GTR":0.0006673893924418096,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413559_California_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006769664214614758,
"Nucleotide GTR":0.0006814566699681628,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006694980039437301,
"Nucleotide GTR":0.0006739387152067018,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "-", "-", "-", "-", "IM", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "AT-", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630725186358476,
"Nucleotide GTR":0.0006674706103169715,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCA", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716148588062,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208071048,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTC", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662526642824523,
"Nucleotide GTR":0.000666921113767646,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624978355851945,
"Nucleotide GTR":0.0006668921154528689,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "A", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "GCT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414522_England_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325116188176692,
"Nucleotide GTR":0.001333905547288924,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCC", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGC", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630079672139477,
"Nucleotide GTR":0.0006674056307321432,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006621620930534934,
"Nucleotide GTR":0.0006665541459755566,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001327097741587744,
"Nucleotide GTR":0.001335900244139536,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "K", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "C", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAA", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGT", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "F", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "TTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629970458433572,
"Nucleotide GTR":0.0006673946369212271,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628812383589539,
"Nucleotide GTR":0.0006672780612977143,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623313639831136,
"Nucleotide GTR":0.0006667245396618088,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "D", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "GAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627508318865103,
"Nucleotide GTR":0.0006671467898525783,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "S", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "TCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129349789,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188705164,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626002813927384,
"Nucleotide GTR":0.000666995240772897,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "S", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "TCA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662660710586124,
"Nucleotide GTR":0.0006670560707868941,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "C", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TGC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629580068604333,
"Nucleotide GTR":0.000667355338996752,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "M", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATG", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628150807565904,
"Nucleotide GTR":0.0006672114648787918,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "I", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ATC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626977011228245,
"Nucleotide GTR":0.0006670933066780123,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTG", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325928773667846,
"Nucleotide GTR":0.001334723522575898,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "L", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "CTT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716148735903,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208219876,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAC", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000213014779181533,
"Nucleotide GTR":0.0002144276842589475,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622422575693479,
"Nucleotide GTR":0.0006666348422143825,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCC", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006637144315078798,
"Nucleotide GTR":0.0006681167809309293,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATA", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629543178864689,
"Nucleotide GTR":0.0006673516255542038,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622822086240139,
"Nucleotide GTR":0.0006666750582602779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTC", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "IF", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "WTT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "TI", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "AYC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628505270941235,
"Nucleotide GTR":0.000667247146328229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "N", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "AAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716149164373,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208651186,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACC", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630146970680699,
"Nucleotide GTR":0.000667412405224694,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129349789,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188705164,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGC", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914082954177,
"Nucleotide GTR":0.0006669863088212365,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "L", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "MV", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "RTG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662616925484897,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952636034,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "F", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTT", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129382664,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188738269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGC", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625781544076925,
"Nucleotide GTR":0.0006669729670218387,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "PS", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "YCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "CF", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TKT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099996955,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105368177,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "S", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "TCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623039596598307,
"Nucleotide GTR":0.0006666969535684731,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATC", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418750_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGY", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418769_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626347023056604,
"Nucleotide GTR":0.0006670298899961871,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "F", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTT", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628728698751242,
"Nucleotide GTR":0.000667269637306593,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129382664,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188738269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "P", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "CCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662601065882431,
"Nucleotide GTR":0.0006669960304660279,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625013884665257,
"Nucleotide GTR":0.000666895691900095,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629500301046734,
"Nucleotide GTR":0.0006673473093319934,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTG", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006637674751748273,
"Nucleotide GTR":0.0006681701764310537,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Q", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAA", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001327331160038611,
"Nucleotide GTR":0.001336135210830933,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "L", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "CTC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628157035937694,
"Nucleotide GTR":0.0006672120918471863,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "V", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "GTG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624844219644362,
"Nucleotide GTR":0.0006668786128609472,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "A", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GCG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "RM", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AKG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628029891081023,
"Nucleotide GTR":0.0006671992930276465,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAG", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629130526510277,
"Nucleotide GTR":0.0006673100866107086,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "L", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CTT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "TI", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "AYT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662517740363183,
"Nucleotide GTR":0.0006669121522571989,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "I", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "ATT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663010321271849,
"Nucleotide GTR":0.0006674080004042674,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627706837528522,
"Nucleotide GTR":0.0006671667733943034,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTG", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCY", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625976976903199,
"Nucleotide GTR":0.0006669926399330464,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "I", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ATA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662600240669694,
"Nucleotide GTR":0.0006669951997797408,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCT", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626607105896057,
"Nucleotide GTR":0.0006670560707903995,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "L", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTG", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623318113004034,
"Nucleotide GTR":0.000666724989946107,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTG", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629476619655728,
"Nucleotide GTR":0.0006673449254852707,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "I", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "ATT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGY", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATW", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628586160110835,
"Nucleotide GTR":0.0006672552888981419,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTY", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420676_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTM", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420742_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "YTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420775_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "TI", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "AYA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTY", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "RI", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AKA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326471906826033,
"Nucleotide GTR":0.001335270258280348,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "G", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622896399695826,
"Nucleotide GTR":0.0006666825388971958,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "D", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GAC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662591410000724,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105378532,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001993140666516201,
"Nucleotide GTR":0.002006360963147933,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "Y", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TAC", "AGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TAT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421662_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631851549453883,
"Nucleotide GTR":0.000667583993731545,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914101788814,
"Nucleotide GTR":0.000666986310717192,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTT", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421807_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129382664,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188738269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "L", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "CTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421831_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630378091381678,
"Nucleotide GTR":0.0006674356705947709,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "I", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ATT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421834_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "YC", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TRC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421843_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625843532646203,
"Nucleotide GTR":0.0006669792069951458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTT", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTR", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421848_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACY", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421851_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "TM", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "AYG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002085323915980954,
"Nucleotide GTR":0.0002099155654606153,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "AV", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GYT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006623348035357505,
"Nucleotide GTR":0.0006667280020286433,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "I", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATT", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002096256354938837,
"Nucleotide GTR":0.0002110160607304967,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099678594,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105047705,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "S", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "TCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629914284247236,
"Nucleotide GTR":0.0006673889822428344,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "YAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629022238469847,
"Nucleotide GTR":0.0006672991859803234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "E", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GAG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129026532,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188379769,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "CTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625177422260889,
"Nucleotide GTR":0.0006669121541324602,
"amino-acid": [
["K", "I", "I", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "ATT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624532749467732,
"Nucleotide GTR":0.0006668472592483256,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002089336794183145,
"Nucleotide GTR":0.0002103195149815901,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423202_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "TA", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "RCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631085762836623,
"Nucleotide GTR":0.0006675069071314487,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "N", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AAC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "SF", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TYT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423436_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006625177422260889,
"Nucleotide GTR":0.0006669121541324602,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "H", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CAC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "GC", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "KGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "AS", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "KCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PL", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CYT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "AV", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GYT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423719_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "NS", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "ART", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423757_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "KN", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAW", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423770_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "SI", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "AKT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423784_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "TI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AYT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACW", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "PA", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "SCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423855_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625177423415549,
"Nucleotide GTR":0.0006669121542486931,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTA", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "TI", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "AYT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423868_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "SF", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TYC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423906_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002095047640964274,
"Nucleotide GTR":0.0002108943876055181,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTY", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002086341224166247,
"Nucleotide GTR":0.0002100179710491798,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424000_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAY", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424001_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "SC", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TSC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424070_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "GC", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "KGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424125_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "AV", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GYA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629130508314568,
"Nucleotide GTR":0.0006673100847790685,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625177404468944,
"Nucleotide GTR":0.0006669121523414658,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "S", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "AGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099996955,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105368177,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTC", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624093403210539,
"Nucleotide GTR":0.0006668030332087616,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCA", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129382664,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188738269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAC", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629794266690062,
"Nucleotide GTR":0.0006673769008807079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623377615118674,
"Nucleotide GTR":0.0006667309796247103,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "R", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CGA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000662989907877172,
"Nucleotide GTR":0.0006673874516096473,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662876996783727,
"Nucleotide GTR":0.0006672737915885559,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "H", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CAC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623612833812305,
"Nucleotide GTR":0.000666754657512209,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "CTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629021593372911,
"Nucleotide GTR":0.0006672991210427453,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACA", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006624716149164373,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208651186,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425615_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002095505068200665,
"Nucleotide GTR":0.0002109404337359288,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623313620869132,
"Nucleotide GTR":0.00066672453775303,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "V", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "GTA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626805579618477,
"Nucleotide GTR":0.0006670760498082149,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "A", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "GCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914081326125,
"Nucleotide GTR":0.0006669863086573514,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "F", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TTT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "IL", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "WTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAY", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623313639735909,
"Nucleotide GTR":0.0006667245396522211,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCG", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "RC", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "YGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631029595130525,
"Nucleotide GTR":0.0006675012531053773,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "C", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TGT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006629750949128876,
"Nucleotide GTR":0.0006673725403924985,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "N", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "AAT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662629129657364,
"Nucleotide GTR":0.0006670242803850887,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "F", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "TTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629796016886996,
"Nucleotide GTR":0.0006673770770612901,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629065517226515,
"Nucleotide GTR":0.0006673035425623442,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169251134128,
"Nucleotide GTR":0.0006670119948896553,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "I", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATT", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626338946044533,
"Nucleotide GTR":0.0006670290769375813,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "GV", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GKT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182040114,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556511158,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAC", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GV", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GKC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325109388565814,
"Nucleotide GTR":0.001333898702576928,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "V", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "GTC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCC", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "SF", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TYT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626714258412017,
"Nucleotide GTR":0.0006670668571151549,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "M", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATG", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421469305683,
"Nucleotide GTR":0.00066693672071083,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "S", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "AGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624540322427786,
"Nucleotide GTR":0.0006668480215673971,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "TTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628401547144786,
"Nucleotide GTR":0.0006672367051496588,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCG", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000208735837625573,
"Nucleotide GTR":0.0002101203609246262,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716129382664,
"Nucleotide GTR":0.0006668657188738269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "A", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GCA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625382507235254,
"Nucleotide GTR":0.0006669327986606471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066296382180636,
"Nucleotide GTR":0.0006673611925126163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628029911914511,
"Nucleotide GTR":0.0006671992951248135,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTG", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099678594,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105047705,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAT", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624297171502532,
"Nucleotide GTR":0.0006668235451953695,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCT", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622438174325858,
"Nucleotide GTR":0.0006666364124240327,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "P", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CCT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006626999123068196,
"Nucleotide GTR":0.0006670955325285634,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623313639866466,
"Nucleotide GTR":0.0006667245396653642,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTG", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTY", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429004_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622549255360098,
"Nucleotide GTR":0.0006666475942063623,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429026_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAY", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429060_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625829020825319,
"Nucleotide GTR":0.0006669777461875169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716148588062,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208071048,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "T", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ACC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATY", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066233136209075,
"Nucleotide GTR":0.0006667245377568928,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTG", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326058056180546,
"Nucleotide GTR":0.001334853662606179,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099996955,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105368177,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAT", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629022238469847,
"Nucleotide GTR":0.0006672991859803234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCA", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914081326286,
"Nucleotide GTR":0.0006669863086573679,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627102729693268,
"Nucleotide GTR":0.0006671059619122768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914082156035,
"Nucleotide GTR":0.0006669863087408918,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "V", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GTT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662902159347293,
"Nucleotide GTR":0.0006672991210528128,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "H", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CAT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006636219532390915,
"Nucleotide GTR":0.0006680236892633149,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGA", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "AV", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GYT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625214237346294,
"Nucleotide GTR":0.0006669158600600683,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "S", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "AGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTY", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627000470824958,
"Nucleotide GTR":0.0006670956681981923,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "V", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GTA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006623313620869132,
"Nucleotide GTR":0.00066672453775303,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTG", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "SI", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AKT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "YTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628084135204158,
"Nucleotide GTR":0.0006672047534195276,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAT", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "PL", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CYA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "C", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGT", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627440821342489,
"Nucleotide GTR":0.0006671399953299053,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716148735903,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208219876,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAC", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629978749978348,
"Nucleotide GTR":0.0006673954715754004,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002085033420201603,
"Nucleotide GTR":0.0002098863231998237,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716148588062,
"Nucleotide GTR":0.0006668657208071048,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCC", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066259769594469,
"Nucleotide GTR":0.0006669926381758387,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "I", "TPAS", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ATA", "-CA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTT", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAY", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTY", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAY", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627663127534044,
"Nucleotide GTR":0.0006671623734024672,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "I", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ATT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCS", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006621008454938848,
"Nucleotide GTR":0.0006664924921671969,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTC", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "SC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "WGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914082954177,
"Nucleotide GTR":0.0006669863088212365,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "S", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "TCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006636918255733593,
"Nucleotide GTR":0.000668094025053575,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "EAGV", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GNA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432680_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629741111300806,
"Nucleotide GTR":0.000667371550084361,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626137605609097,
"Nucleotide GTR":0.0006670088093470012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "E", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAG", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433033_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326821614789537,
"Nucleotide GTR":0.001335622285820733,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "ILVF", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "NTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625851219955507,
"Nucleotide GTR":0.0006669799808249893,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACC", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625177403578016,
"Nucleotide GTR":0.0006669121522517818,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "T", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "ACA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632859142907339,
"Nucleotide GTR":0.0006676854214032449,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGA", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623318108541701,
"Nucleotide GTR":0.0006667249894969139,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCG", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002087358274877173,
"Nucleotide GTR":0.0002101203507195275,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002088178909751708,
"Nucleotide GTR":0.0002102029585256363,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002096350210558536,
"Nucleotide GTR":0.0002110255085459321,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002096191523328632,
"Nucleotide GTR":0.0002110095345673378,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "S", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "TCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625851219955349,
"Nucleotide GTR":0.0006669799808249737,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCC", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626157271139512,
"Nucleotide GTR":0.0006670107889439866,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "M", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATG", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433875_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006625914099996955,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105368177,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCT", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433875_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629064354631859,
"Nucleotide GTR":0.0006673034255317417,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "V", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GTA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628773445535105,
"Nucleotide GTR":0.0006672741416650603,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625851219955507,
"Nucleotide GTR":0.0006669799808249893,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAC", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662989341441759,
"Nucleotide GTR":0.0006673868814171267,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627150403237244,
"Nucleotide GTR":0.0006671107608880456,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006629039528718077,
"Nucleotide GTR":0.000667300926473591,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326341015333217,
"Nucleotide GTR":0.001335138498597749,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAT", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAT", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630624357650388,
"Nucleotide GTR":0.0006674604605675195,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624248666448452,
"Nucleotide GTR":0.000666818662517058,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914100007401,
"Nucleotide GTR":0.0006669863105378693,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTT", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624716147836353,
"Nucleotide GTR":0.000666865720731436,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "A", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GCG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002094740355342332,
"Nucleotide GTR":0.0002108634552239376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "L", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "TTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625914082954177,
"Nucleotide GTR":0.0006669863088212365,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAT", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626169255109638,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952898426,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "I", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "ATT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "L", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "TTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629304171597293,
"Nucleotide GTR":0.0006673275662964071,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAG", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006626996593187337,
"Nucleotide GTR":0.0006670952778624335,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626607109433343,
"Nucleotide GTR":0.0006670560711464737,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "Q", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAG", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002094740355139437,
"Nucleotide GTR":0.0002108634552035138,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "TI", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "AYT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "IV", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "RTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "TR", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "ASA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "PL", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CYT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "DA", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GMT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066251774230007,
"Nucleotide GTR":0.0006669121542069328,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623313639516937,
"Nucleotide GTR":0.00066672453963018,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCG", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625914082954177,
"Nucleotide GTR":0.0006669863088212365,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "TTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435596_California_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326361539926378,
"Nucleotide GTR":0.001335159159328423,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "G", "V", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GGT", "GTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435626_California_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325780952409101,
"Nucleotide GTR":0.001334574720833978,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGC", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAA", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435636_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "DG", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GRT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "IV", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "RTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "AV", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GYA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662543514638706,
"Nucleotide GTR":0.0006669380974908348,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTY", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAR", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436432714,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526765121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAT", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626651132276511,
"Nucleotide GTR":0.0006670605026306892,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTA", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "KR", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "ARG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631840553106729,
"Nucleotide GTR":0.0006675828868030661,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626228435981128,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526310542,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "TTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182040114,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556511158,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "P", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "CCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622566164218225,
"Nucleotide GTR":0.0006666492963076467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "T", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ACT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631811973878706,
"Nucleotide GTR":0.0006675800099239569,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "F", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TTC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623176776720504,
"Nucleotide GTR":0.0006667107625708542,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "L", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "CTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "YS", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TMT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "YS", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TMT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "AV", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GYT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "YF", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TWC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TMA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662677512636743,
"Nucleotide GTR":0.0006670729842837837,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "I", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ATA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626291297019486,
"Nucleotide GTR":0.000667024280429969,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAT", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0002088178909550019,
"Nucleotide GTR":0.0002102029585053332,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002087358271111115,
"Nucleotide GTR":0.0002101203503404239,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "AS", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "KCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622822106194995,
"Nucleotide GTR":0.0006666750602689988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGC", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "AG", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GST", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATY", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCK", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622822086240139,
"Nucleotide GTR":0.0006666750582602779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAC", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625735802121515,
"Nucleotide GTR":0.0006669683624861314,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "S", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "AGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662573580167099,
"Nucleotide GTR":0.0006669683624407795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "S", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623953322993902,
"Nucleotide GTR":0.0006667889322733338,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "A", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006622822106194995,
"Nucleotide GTR":0.0006666750602689988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAC", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662950210125556,
"Nucleotide GTR":0.0006673474905469351,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627837354964502,
"Nucleotide GTR":0.0006671799117087724,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAT", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626403037581618,
"Nucleotide GTR":0.0006670355286025453,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "D", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAT", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622822087153536,
"Nucleotide GTR":0.0006666750583522226,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "T", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ACC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631562165709761,
"Nucleotide GTR":0.0006675548634118781,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATA", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006623924370295163,
"Nucleotide GTR":0.0006667860177994333,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006625978724290666,
"Nucleotide GTR":0.0006669928158308167,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "L", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "CTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623953304084978,
"Nucleotide GTR":0.0006667889303698997,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "V", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006623953323041716,
"Nucleotide GTR":0.0006667889322781471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "V", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "GTT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437572_California_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629685423683132,
"Nucleotide GTR":0.0006673659443855699,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627837334798025,
"Nucleotide GTR":0.0006671799096787476,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAT", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623264009080258,
"Nucleotide GTR":0.0006667195436671549,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629587779770628,
"Nucleotide GTR":0.0006673561152281184,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "S", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "AGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628501095703433,
"Nucleotide GTR":0.0006672467260350569,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002582842944500987,
"Nucleotide GTR":0.0002599974675569002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TP", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "MCC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PS", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "YCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002151910591991954,
"Nucleotide GTR":0.0002166183993176838,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "LF", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTN", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "VF", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "KTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169250805606,
"Nucleotide GTR":0.0006670119948565846,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "F", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTT", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACT", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627837336792049,
"Nucleotide GTR":0.0006671799098794734,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "V", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GTT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626039833740649,
"Nucleotide GTR":0.0006669989673090832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "I", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ATT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623748390349287,
"Nucleotide GTR":0.000666768303079162,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "RG", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "RGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438335_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626162617888849,
"Nucleotide GTR":0.0006670113271653643,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTT", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438337_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCR", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662282208711122,
"Nucleotide GTR":0.0006666750583479631,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTC", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438432_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623772159478938,
"Nucleotide GTR":0.000666770695757945,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "N", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "AAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438451_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000662288605614375,
"Nucleotide GTR":0.0006666814976812156,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAC", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628098858257091,
"Nucleotide GTR":0.0006672062354904704,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "V", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "GTA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438654_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006624297172494914,
"Nucleotide GTR":0.0006668235452952655,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTT", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438727_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623441604124945,
"Nucleotide GTR":0.0006667374209685858,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGG", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438729_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "SC", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "WGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169250805606,
"Nucleotide GTR":0.0006670119948565846,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "L", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "TTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "PS", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "YCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625440576168147,
"Nucleotide GTR":0.0006669386440704627,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "C", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGT", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627837354964502,
"Nucleotide GTR":0.0006671799117087724,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGT", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325367080715612,
"Nucleotide GTR":0.0013341581039722,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "A", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAC", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "GCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "SI", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AKT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625735802347418,
"Nucleotide GTR":0.000666968362508871,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "T", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "ACT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624844198691833,
"Nucleotide GTR":0.0006668786107517961,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCC", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629918637527389,
"Nucleotide GTR":0.000667389420458335,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628240543208253,
"Nucleotide GTR":0.0006672204979637541,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "T", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623441604124945,
"Nucleotide GTR":0.0006667374209685858,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "A", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "GCA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169251659031,
"Nucleotide GTR":0.0006670119949424934,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTT", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625735802474382,
"Nucleotide GTR":0.0006669683625216516,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTA", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439427_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627837336792049,
"Nucleotide GTR":0.0006671799098794734,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "F", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "TTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439444_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634705954093046,
"Nucleotide GTR":0.0006678713274926423,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "I", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "ATC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439466_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439512_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "AV", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GYT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439512_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTR", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439513_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_439528_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439528_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627837352647744,
"Nucleotide GTR":0.0006671799114755596,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTT", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439562_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006622822086413938,
"Nucleotide GTR":0.0006666750582777723,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "L", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "CTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439648_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "LF", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "YTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439651_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625295724075387,
"Nucleotide GTR":0.0006669240627822853,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "I", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATA", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439654_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACY", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439661_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634705910644442,
"Nucleotide GTR":0.0006678713231189632,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTA", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439664_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006628491792063086,
"Nucleotide GTR":0.0006672457895000139,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTT", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439810_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "EG", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GRA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439877_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "RI", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AKA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439878_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625547202080829,
"Nucleotide GTR":0.000666949377385599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "T", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "ACA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439888_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622822087153536,
"Nucleotide GTR":0.0006666750583522226,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAC", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439903_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGY", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439910_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCY", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439976_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "LF", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "YTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439985_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625783014925745,
"Nucleotide GTR":0.0006669731150823204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "F", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "TTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440024_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAY", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440043_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622822086271143,
"Nucleotide GTR":0.0006666750582633978,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "H", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "CAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440056_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002088761363702156,
"Nucleotide GTR":0.0002102615902563832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "I", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ATT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440071_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006623953304084978,
"Nucleotide GTR":0.0006667889303698997,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "V", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "GTT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634540929832401,
"Nucleotide GTR":0.0006678547156076859,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440140_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "VF", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "KTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440193_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "SL", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TYA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440223_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAY", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440274_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAY", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440287_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629413402529178,
"Nucleotide GTR":0.0006673385618413478,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCC", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440298_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "SG", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "RGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440360_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "SI", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AKT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "YTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440411_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "PA", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "SCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440415_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623953323204313,
"Nucleotide GTR":0.0006667889322945147,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "A", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "GCA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440422_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002096191522719846,
"Nucleotide GTR":0.0002110095345060552,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440437_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440485_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002088470091044578,
"Nucleotide GTR":0.0002102322697924738,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440558_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440561_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "RC", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "YGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440580_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTY", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440623_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627837334797763,
"Nucleotide GTR":0.000667179909678721,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAT", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440728_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003286648466852594,
"Nucleotide GTR":0.0003308448467417512,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440742_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "TI", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "AYA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440785_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440907_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631629076491773,
"Nucleotide GTR":0.0006675615988713109,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "L", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTA", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACN", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441056_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "TR", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "-", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ASA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "---", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441078_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACY", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623953323204313,
"Nucleotide GTR":0.0006667889322945147,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "R", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AGG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441269_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623953322993902,
"Nucleotide GTR":0.0006667889322733338,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "D", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441277_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000212037648634993,
"Nucleotide GTR":0.0002134440725061939,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441294_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "SG", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "RGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441295_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAY", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441311_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006627797613362632,
"Nucleotide GTR":0.0006671759111883903,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTA", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441321_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625344975034865,
"Nucleotide GTR":0.0006669290205458866,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441352_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003056085624954475,
"Nucleotide GTR":0.0003076356325950451,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441525_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441554_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441555_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "DG", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GRT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441603_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006623953303230196,
"Nucleotide GTR":0.0006667889302838543,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTG", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "TI", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "AYA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441700_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006634708700997008,
"Nucleotide GTR":0.0006678716040050314,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTA", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441740_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTY", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441756_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "TI", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "AYT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "HY", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "YAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441832_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002652121415366089,
"Nucleotide GTR":0.002669712663391644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "N", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442025_England_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006627903566271006,
"Nucleotide GTR":0.0006671865767567,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAT", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442025_England_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442055_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623952687795937,
"Nucleotide GTR":0.0006667888683322169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "S", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TCA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442055_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTK", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442086_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622422575769008,
"Nucleotide GTR":0.000666634842221987,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "A", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GCA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442090_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442107_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442107_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "LF", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTK", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_442153_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAY", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442205_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442210_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCC", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442239_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "I", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATT", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442247_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623633532151767,
"Nucleotide GTR":0.0006667567410751501,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "G", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "GGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442261_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GC", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "KGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442271_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTY", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442298_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTY", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442311_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006622422575693479,
"Nucleotide GTR":0.0006666348422143825,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "T", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ACC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442366_England_20200409_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442433_England_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006622438174898494,
"Nucleotide GTR":0.0006666364124816764,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGC", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442433_England_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002087887615376173,
"Nucleotide GTR":0.000210173635875525,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442476_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626228417451993,
"Nucleotide GTR":0.0006670179507658505,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "I", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ATT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442484_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "HY", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "YAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442553_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "AV", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GYT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442559_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421468987166,
"Nucleotide GTR":0.0006669367206787671,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "S", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "AGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442571_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "KN", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAW", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442609_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "AV", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GYC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442635_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628029891081023,
"Nucleotide GTR":0.0006671992930276465,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "G", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "GGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442637_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442649_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442649_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624350288580481,
"Nucleotide GTR":0.0006668288921351747,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442650_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "AV", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GYA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442677_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCC", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442721_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442806_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442823_England_20200411_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442823_England_20200411_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "TI", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "AYA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442827_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACK", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442847_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TI", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AYC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442884_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "VF", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "KTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442891_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623633532151767,
"Nucleotide GTR":0.0006667567410751501,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "R", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CGT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442916_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "DY", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "KAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442933_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGY", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442941_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "AG", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GSC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442946_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622257269024489,
"Nucleotide GTR":0.0006666182019012734,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAG", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442962_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436428477,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526760861,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "V", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442982_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443008_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626126848335978,
"Nucleotide GTR":0.0006670077264845017,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "N", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAC", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443035_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421451213618,
"Nucleotide GTR":0.0006669367188896244,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "N", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "AAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443070_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "LF", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTW", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443073_England_20200411_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "IF", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "WTT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCW", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "TS", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "WCA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436432714,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526765121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGT", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006626228417451993,
"Nucleotide GTR":0.0006670179507658505,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "I", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ATA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623633512594988,
"Nucleotide GTR":0.0006667567391065009,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCG", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002088470090576477,
"Nucleotide GTR":0.000210232269745353,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627837334374242,
"Nucleotide GTR":0.0006671799096360884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAT", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAY", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443322_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "H", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "CAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443344_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443365_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622422567254023,
"Nucleotide GTR":0.0006666348413648401,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTC", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443378_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443379_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002085852756090413,
"Nucleotide GTR":0.0002099688002457559,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443379_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443384_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443411_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAY", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443411_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443473_England_20200414_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443473_England_20200414_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "A", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GCT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443488_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "AV", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GYA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443492_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "HY", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "YAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443508_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182040114,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556511158,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTC", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443513_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623633512594988,
"Nucleotide GTR":0.0006667567391065009,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAG", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443592_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626403037585186,
"Nucleotide GTR":0.0006670355286029047,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "N", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAT", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443658_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "TI", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "AYA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443659_England_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "PS", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "YCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443666_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626607125005095,
"Nucleotide GTR":0.0006670560727139768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "A", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "GCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443754_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "NI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AWT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443766_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443778_England_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006626228419577587,
"Nucleotide GTR":0.0006670179509798201,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAT", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443778_England_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629075842647765,
"Nucleotide GTR":0.0006673045819532151,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "L", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "TTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443780_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662791436195968,
"Nucleotide GTR":0.0006671876634862366,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "S", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAY", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443794_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "PA", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "SCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629442807567634,
"Nucleotide GTR":0.0006673415218492509,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "K", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAA", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443875_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623318106016948,
"Nucleotide GTR":0.0006667249892427643,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "S", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "AGC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443932_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACR", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443939_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "AV", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GYT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443953_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006625421451694459,
"Nucleotide GTR":0.0006669367189380268,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAA", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444077_California_20200430_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325405349805364,
"Nucleotide GTR":0.001334196626896879,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "T", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTT", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ACT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006623495396853749,
"Nucleotide GTR":0.00066674283592163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444128_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444134_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444151_England_20200409_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0002094581767361333,
"Nucleotide GTR":0.0002108474912360644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444151_England_20200409_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444193_England_20200414_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444193_England_20200414_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444215_England_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421451213462,
"Nucleotide GTR":0.000666936718889608,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "N", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "AAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444218_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444219_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444219_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444238_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444238_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626607124445697,
"Nucleotide GTR":0.0006670560726576668,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "L", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTG", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000662250218207771,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556549002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAC", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444243_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623318108218331,
"Nucleotide GTR":0.0006667249894643623,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "C", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TGC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444244_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006627938117995102,
"Nucleotide GTR":0.0006671900548469121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444247_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444248_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444248_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444257_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006623633532151767,
"Nucleotide GTR":0.0006667567410751501,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "G", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GGA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444257_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662542145201183,
"Nucleotide GTR":0.0006669367189699745,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTA", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421450376989,
"Nucleotide GTR":0.0006669367188054053,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "I", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "ATC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444293_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625843034843332,
"Nucleotide GTR":0.0006669791568846721,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTA", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444369_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444373_England_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006623633512594988,
"Nucleotide GTR":0.0006667567391065009,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "G", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "GGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444373_England_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444398_England_20200419_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444420_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436432714,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526765121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "I", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ATA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444420_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626235971644847,
"Nucleotide GTR":0.0006670187111957549,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0006624314177718721,
"Nucleotide GTR":0.0006668252570970358,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "F", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "TTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628327872502301,
"Nucleotide GTR":0.000667229288817779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0.000662813992065738,
"Nucleotide GTR":0.0006672103689667652,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "S", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "TCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623428175421719,
"Nucleotide GTR":0.0006667360691911429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000662622843678448,
"Nucleotide GTR":0.0006670179527119219,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Y", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0002090673537122867,
"Nucleotide GTR":0.0002104540759233778,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626288388631359,
"Nucleotide GTR":0.0006670239876620529,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTA", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182040114,
"Nucleotide GTR":0.0006666428556511158,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAC", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182536493,
"Nucleotide GTR":0.0006666428557010821,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATC", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622502182962853,
"Nucleotide GTR":0.0006666428557440014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAC", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006638937538541276,
"Nucleotide GTR":0.0006682972927038196,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTA", "---", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622422575769008,
"Nucleotide GTR":0.000666634842221987,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "S", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TCC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006623953304424381,
"Nucleotide GTR":0.0006667889304040652,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "V", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "GTG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444954_Unknown_20200331_null_11":{
"Global MG94xREV":0.000662386486339899,
"Nucleotide GTR":0.0006667800276395048,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444954_Unknown_20200331_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60":{
"Global MG94xREV":0.0006628306365828005,
"Nucleotide GTR":0.0006672271238851939,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002088470089347801,
"Nucleotide GTR":0.0002102322696216706,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "I", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ATT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622502163029786,
"Nucleotide GTR":0.0006666428537374741,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "L", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "CTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630010666856706,
"Nucleotide GTR":0.0006673986844333726,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACA", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445012_Florida_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0002586997091039833,
"Nucleotide GTR":0.000260415637613372,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445012_Florida_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000662437357558918,
"Nucleotide GTR":0.0006668312362820775,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445039_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445039_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169254780103,
"Nucleotide GTR":0.0006670119952566711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "F", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTT", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662550807611257,
"Nucleotide GTR":0.0006669454388369215,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "C", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "TGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445045_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626169250805606,
"Nucleotide GTR":0.0006670119948565846,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "F", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "TTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445045_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_66":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_66",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006622502162847167,
"Nucleotide GTR":0.0006666428537190906,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGC", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445110_California_20200326_null_56":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445110_California_20200326_null_56",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630010458476276,
"Nucleotide GTR":0.000667398663457114,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "L", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTA", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006623776435111258,
"Nucleotide GTR":0.0006667711261571604,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "I", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ATA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445162_Louisiana_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002088470195039958,
"Nucleotide GTR":0.0002102322802609908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445162_Louisiana_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002095313135636266,
"Nucleotide GTR":0.0002109211131725968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "IM", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATR", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "GC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "KGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623569562361386,
"Nucleotide GTR":0.0006667503016656098,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTG", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445521_Wales_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445521_Wales_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006635981756081671,
"Nucleotide GTR":0.0006679997539178153,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "---", "CTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445600_Wales_20200406_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445600_Wales_20200406_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625403896791449,
"Nucleotide GTR":0.000666934951803739,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "KE", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "RAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445654_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628407560590683,
"Nucleotide GTR":0.0006672373104829054,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445654_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626039833740649,
"Nucleotide GTR":0.0006669989673090832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "M", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ATG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623633532467001,
"Nucleotide GTR":0.0006667567411068832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTG", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445701_Wales_20200412_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445701_Wales_20200412_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTY", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445897_Wales_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006625208486991256,
"Nucleotide GTR":0.0006669152812104144,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTC", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445897_Wales_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006624908224297537,
"Nucleotide GTR":0.000666885055779891,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGC", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "IV", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "RTT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACY", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446016_Wales_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002088178807172694,
"Nucleotide GTR":0.0002102029481996949,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446016_Wales_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623505586301842,
"Nucleotide GTR":0.0006667438616249959,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "S", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AGC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000662660712415396,
"Nucleotide GTR":0.0006670560726282987,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "R", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CGT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446175_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAY", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446175_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623318105844034,
"Nucleotide GTR":0.0006667249892253577,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "G", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GGA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTK", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446233_Wales_20200406_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446233_Wales_20200406_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623569562319237,
"Nucleotide GTR":0.0006667503016613668,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "M", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATG", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0002088470091363294,
"Nucleotide GTR":0.0002102322698245567,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446380_Wales_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625130950520162,
"Nucleotide GTR":0.0006669074761341613,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "L", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TTG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446380_Wales_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0002087887615644177,
"Nucleotide GTR":0.0002101736359025036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "TI", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "AYT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446534_Wales_20200411_null_53":{
"Global MG94xREV":0.0006623501281998316,
"Nucleotide GTR":0.0006667434283396411,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446534_Wales_20200411_null_53",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446552_Wales_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446552_Wales_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436751961,
"Nucleotide GTR":0.0006670179527086486,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "I", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ATT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625406455895793,
"Nucleotide GTR":0.0006669352094116014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "A", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "GCA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAY", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "TI", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "AYC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "GV", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GKT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTK", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006623329953862541,
"Nucleotide GTR":0.0006667261818858771,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATC", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446790_Wales_20200421_null_62":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446790_Wales_20200421_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006622502162884259,
"Nucleotide GTR":0.0006666428537228242,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGC", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446807_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446807_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006626228436300385,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526631912,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "L", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TTA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325930471041406,
"Nucleotide GTR":0.001334725231207962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "M", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "ATG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAT", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATY", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006625421469305683,
"Nucleotide GTR":0.00066693672071083,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "H", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CAT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000662660710586124,
"Nucleotide GTR":0.0006670560707868941,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "C", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TGC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446915_Wales_20200417_null_138":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446915_Wales_20200417_null_138",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000662902159347293,
"Nucleotide GTR":0.0006672991210528128,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATA", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "TTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006626607105862004,
"Nucleotide GTR":0.0006670560707869715,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGG", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446996_Bangkok_20200328_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446996_Bangkok_20200328_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447003_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626228435981128,
"Nucleotide GTR":0.0006670179526310542,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "V", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GTT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447003_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "PS", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "YCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002088178806801313,
"Nucleotide GTR":0.0002102029481623102,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447013_Bangkok_20200303_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0002088470195803569,
"Nucleotide GTR":0.0002102322803378583,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447013_Bangkok_20200303_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447029_Bangkok_20200407_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447029_Bangkok_20200407_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447032_Gujarat_20200503_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447032_Gujarat_20200503_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000662306311462294,
"Nucleotide GTR":0.0006666993209702001,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCT", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "TI", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "AYT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "MI", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATK", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "TI", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "AYA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447187_Michigan_20200313_null_290":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447187_Michigan_20200313_null_290",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447191_Michigan_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "AV", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GYT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447191_Michigan_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447226_Michigan_20200422_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0002561133196840799,
"Nucleotide GTR":0.0002578120929389946,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447226_Michigan_20200422_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447238_Kinshasa_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421469305683,
"Nucleotide GTR":0.00066693672071083,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "I", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "ATA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447238_Kinshasa_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002087887509148945,
"Nucleotide GTR":0.0002101736251823429,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_1729":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_1729",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625421469305683,
"Nucleotide GTR":0.00066693672071083,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "T", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "ACT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "TPAS", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "NCT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006622822086240139,
"Nucleotide GTR":0.0006666750582602779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGC", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_22131":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_22131",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "F", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "TTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":14258.7299702888,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02253952718931155],
[0.01128098850356032],
[0.008622306750929815],
[0.0358753571622901],
[0.01917761991318515],
[0.009598360602208318],
[0.007336237368929167],
[0.03052432990850056],
[0.01421481075110571],
[0.007114484492804799],
[0.005437756421109387],
[0.02262520453100307],
[0.02691322368248041],
[0.01347001489453525],
[0.01029542759693633],
[0.04283681303019737],
[0.01064670980490788],
[0.005328657069916878],
[0.004072809383045969],
[0.01694598620664289],
[0.009058688420994396],
[0.004533855527503374],
[0.003465325145061103],
[0.01441838951613794],
[0.006714469373185182],
[0.003360578559177997],
[0.002568563844266442],
[0.01068718012117423],
[0.01271265719352896],
[0.006362659626591925],
[0.004863120198634886],
[0.02023428058046758],
[0.02285895947692354],
[0.01144086372782526],
[0.008744502888710731],
[0.03638378607967582],
[0.01944940693641637],
[0.009734389466466934],
[0.007440207211132995],
[0.03095692356712527],
[0.01441626437868449],
[0.007215311632506043],
[0.005514820813742054],
[0.02294585104591554],
[0.02729464040589707],
[0.01366091320556856],
[0.01044133535984595],
[0.04344390035129841],
[0.0132226281864207],
[0.04205008352435559],
[0.02247839695364591],
[0.01125039294226163],
[0.008598921892887372],
[0.03577805835830454],
[0.008339001777789613],
[0.006373681818925598],
[0.02651936637119673],
[0.0315454226319882],
[0.0157884212504761],
[0.01206743638569793],
[0.05020971798799001]
],
"Log Likelihood":-6309.327690297988,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.4632449289333327, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5077503740206051, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":818
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":15517.74925309513,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2659936950393275],
[0.177109658891697],
[0.1873200066474674],
[0.3695766394215082]
],
"Log Likelihood":-6436.106430867308,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1182312995573343,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1888096215206226,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04121615617153872,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.999775976315611,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4294005397298657
},
"display order":0,
"estimated parameters":1321
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-17/sequences.nsp4.compressed.fas",
"number of sequences":658,
"number of sites":501,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_423436_England_20200330_null_1,epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9)Node1,(epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_441294_England_20200402_null_1)Node1311,(epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1,epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1)Node1308,(epi_isl_421843_England_20200324_null_1,epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2)Node1305,(epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1)Node1302,(epi_isl_423202_England_20200324_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_1)Node1299,(epi_isl_423868_England_20200318_null_3,epi_isl_423952_England_20200319_null_1)Node1296,(epi_isl_424000_England_20200321_null_3,epi_isl_424001_England_20200319_null_1)Node1293,(epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1)Node1287,(epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1)Node1284,epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1,epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1,(epi_isl_440437_England_20200316_null_1,epi_isl_442553_England_20200407_null_1)Node1281,(epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2,epi_isl_446175_Wales_20200406_null_2)Node1278,(epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1,epi_isl_439661_England_20200327_null_2)Node1275,epi_isl_438451_England_20200330_null_1,epi_isl_442933_England_20200407_null_1,(epi_isl_439512_England_20200331_null_2,epi_isl_444151_England_20200409_null_10)Node1269,(epi_isl_439877_England_20200323_null_1,epi_isl_443379_England_20200415_null_4)Node1266,(epi_isl_440071_England_20200319_null_1,epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1)Node1263,epi_isl_443780_England_20200327_null_2,epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1,(epi_isl_441700_England_20200406_null_3,epi_isl_445162_Louisiana_20200402_null_6)Node1257,(epi_isl_440558_England_20200402_null_1,epi_isl_441798_England_20200403_null_1)Node1254,(epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2,epi_isl_447191_Michigan_20200315_null_2)Node1251,(epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1,epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1)Node1248,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2,epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9)Node1245,(epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3,epi_isl_447013_Bangkok_20200303_null_8)Node1242,epi_isl_420742_England_20200328_null_1,epi_isl_438727_England_20200426_null_2,(epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8)Node1236,(epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6)Node1233,(epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_440274_England_20200314_null_1)Node1230,(epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2,epi_isl_441295_England_20200402_null_1)Node1227,(epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1)Node1224,(epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3,epi_isl_446016_Wales_20200405_null_4)Node1221,(epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2)Node1218,(epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4,epi_isl_442298_England_20200405_null_1)Node1215,(epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1,epi_isl_439910_England_20200324_null_1)Node1212,(epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2,epi_isl_446451_Wales_20200411_null_13)Node1209,(epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1,epi_isl_442476_England_20200411_null_2)Node1206,(epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6)Node1203,(epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1)Node1199,epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4,epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1,epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1,epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1,epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1,epi_isl_425615_England_20200329_null_3,epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1,epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1,epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1,epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1,epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1,epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2,epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1,epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_423509_England_20200331_null_6,epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1,epi_isl_433875_England_20200408_null_3,epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1,epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1,epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1,epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1,epi_isl_421807_England_20200325_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_421831_England_20200323_null_3,(epi_isl_435626_California_20200307_null_1,epi_isl_443953_England_20200330_null_7,epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3,epi_isl_446233_Wales_20200406_null_30)Node781,((epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1,epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3,epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_441603_England_20200406_null_1)Node773,epi_isl_440287_England_20200321_null_2)Node772,((epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1,epi_isl_445039_Florida_20200428_null_1)Node768,epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2)Node767,((epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1,epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2)Node763,epi_isl_421851_England_20200327_null_1)Node762,((epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_444248_England_20200418_null_4)Node758,epi_isl_420775_England_20200330_null_1)Node757,((epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_445600_Wales_20200406_null_21)Node753,epi_isl_443073_England_20200411_null_7)Node752,(epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_440561_England_20200402_null_1)Node747,(epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1,epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8)Node744,(epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1,epi_isl_442637_England_20200407_null_1,epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3)Node739,((epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1,epi_isl_445084_Texas_20200325_null_66)Node735,epi_isl_446996_Bangkok_20200328_null_6)Node734,(epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5,epi_isl_444238_England_20200418_null_4)Node731,(epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2,epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6)Node728,(epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1,epi_isl_446552_Wales_20200414_null_2)Node725,(epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2,epi_isl_439825_England_20200415_null_16)Node722,(epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1)Node719,(epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2,epi_isl_441554_England_20200406_null_2)Node716,(epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1,epi_isl_440485_England_20200311_null_1)Node713,(epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1)Node710,(epi_isl_420676_England_20200328_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1)Node707,epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2,(epi_isl_414619_USA_20200307_null_1,epi_isl_442107_England_20200405_null_5)Node703,(epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1)Node700,(epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1,epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1)Node697,(epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1)Node694,((epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1,epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1)Node660,epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1,epi_isl_429060_California_20200331_null_1,epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1,(epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1)Node656,epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_1729,epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1,(epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1,epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4)Node649,epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1,epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1,epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15,epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2,epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1,epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1,(epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1,epi_isl_447029_Bangkok_20200407_null_30)Node664,epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1,epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2,epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_447187_Michigan_20200313_null_290,epi_isl_439651_England_20200325_null_1,epi_isl_440043_England_20200313_null_1,epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1)Node670,(epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1,epi_isl_440140_England_20200315_null_1)Node687)Node590,(epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2)Node691,(epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15,epi_isl_444219_England_20200415_null_1)Node789,(epi_isl_441352_England_20200420_null_1,epi_isl_441555_England_20200405_null_1)Node792,(epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1,epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5,epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1)Node803,(epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2)Node797,(epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_444193_England_20200414_null_10)Node800,((epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4)Node810,epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1)Node809,epi_isl_442055_England_20200406_null_1,epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2,((epi_isl_445654_Wales_20200407_null_1,epi_isl_446915_Wales_20200417_null_138,epi_isl_440360_England_20200321_null_1,epi_isl_439810_England_20200413_null_2,epi_isl_443666_England_20200413_null_1)Node819,epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9)Node818,((epi_isl_432680_England_20200406_null_1,epi_isl_446807_Wales_20200416_null_8)Node830,epi_isl_440223_England_20200321_null_1)Node829,((epi_isl_423804_England_20200324_null_2,epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1)Node836,epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1)Node835,((epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4,epi_isl_446790_Wales_20200421_null_62)Node841,epi_isl_443659_England_20200416_null_7)Node840,((epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11)Node849,epi_isl_440411_England_20200312_null_1)Node848,(epi_isl_440742_England_20200403_null_2,epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7)Node853,epi_isl_444128_England_20200408_null_4,epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1,epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2,((epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8)Node876,epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4)Node875,epi_isl_443365_England_20200415_null_2,(epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_442891_England_20200407_null_1,epi_isl_443473_England_20200414_null_39)Node866,(epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1,epi_isl_432713_England_20200325_null_1)Node871,epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1,epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1,(epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1,epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_11)Node549,epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2,epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1,epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1,(epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5,epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17,(epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1,epi_isl_414522_England_20200228_null_1)Node900,epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1)Node897,(epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1,epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60)Node894,epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8,epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_447032_Gujarat_20200503_null_6)Node886,epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3,epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1,(epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14,epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2)Node537,((epi_isl_443008_England_20200407_null_2,epi_isl_444247_England_20200418_null_3)Node541,epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1)Node540,epi_isl_420210_England_20200327_null_1,epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3,(epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2,epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1)Node522,epi_isl_439888_England_20200323_null_2,((epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_442210_England_20200403_null_2)Node530,epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1)Node529,epi_isl_439654_England_20200328_null_2,((epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_442823_England_20200411_null_15)Node513,epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4)Node512,epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,epi_isl_441832_England_20200403_null_4,(epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_445701_Wales_20200412_null_17,epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1,epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1)Node915,(epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2,epi_isl_441918_England_20200410_null_1)Node922,epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1,(epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_441525_England_20200423_null_4)Node506,(epi_isl_418750_England_20200318_null_1,epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1,epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1,epi_isl_421662_India_20200310_null_1,epi_isl_445110_California_20200326_null_56)Node492,(epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_433033_England_20200403_null_3,epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1)Node501,epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12,epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1,epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1,((epi_isl_445521_Wales_20200403_null_6,epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6,epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1)Node480,epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2)Node479,epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_441311_England_20200402_null_1,epi_isl_442677_England_20200405_null_1,(epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_444134_England_20200408_null_1)Node1144,epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1,epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_443322_England_20200412_null_1,epi_isl_443766_England_20200328_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_443939_England_20200326_null_1,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1,epi_isl_423906_England_20200319_null_1,(epi_isl_443794_England_20200330_null_1,epi_isl_445012_Florida_20200417_null_5)Node1097,(epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1,epi_isl_429026_California_20200331_null_1)Node1100,epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1,epi_isl_439878_England_20200323_null_1,epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1,epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1,epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1,epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1,epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1,epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1,epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_2,epi_isl_424125_England_20200311_null_1,epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1,epi_isl_435636_California_20200311_null_1,epi_isl_439976_England_20200320_null_1,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_423701_England_20200323_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1,(epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3)Node1068,epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_442827_England_20200407_null_1,epi_isl_442847_England_20200408_null_1,epi_isl_442271_England_20200406_null_1,epi_isl_442635_England_20200406_null_1,epi_isl_441756_England_20200405_null_1,epi_isl_442205_England_20200407_null_1,epi_isl_440415_England_20200313_null_1,epi_isl_440580_England_20200403_null_1,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1,epi_isl_440785_England_20200402_null_1,epi_isl_441109_England_20200402_null_2,epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_438335_England_20200328_null_1,epi_isl_438428_England_20200330_null_1,epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_442941_England_20200407_null_1,epi_isl_442946_England_20200408_null_1,epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_423210_England_20200327_null_1,epi_isl_442884_England_20200407_null_1,epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1,epi_isl_423855_England_20200317_null_1,epi_isl_423770_England_20200322_null_1,epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1,epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1,epi_isl_424070_England_20200321_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,(epi_isl_443492_England_20200414_null_2,epi_isl_447226_Michigan_20200422_null_13)Node948,((epi_isl_413559_California_20200227_null_1,epi_isl_443384_England_20200414_null_2)Node952,epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1)Node951,epi_isl_438729_England_20200426_null_1,(epi_isl_421834_England_20200326_null_1,epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1)Node465,epi_isl_443658_England_20200417_null_2,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2,(epi_isl_442086_England_20200405_null_1,epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_6)Node458,epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1,epi_isl_423757_England_20200324_null_1,epi_isl_421848_England_20200327_null_1,epi_isl_429004_California_20200328_null_1,(epi_isl_442649_England_20200407_null_2,epi_isl_442650_England_20200406_null_1)Node965,epi_isl_446534_Wales_20200411_null_53,epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1,(epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2)Node451,epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,epi_isl_441056_England_20200403_null_1,epi_isl_423558_England_20200331_null_1,epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1,((epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8,epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1,epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1)Node1023,epi_isl_443411_England_20200415_null_1)Node1022,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,((epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_5)Node979,epi_isl_439528_England_20200401_null_1)Node978,epi_isl_418769_England_20200318_null_1,epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,((epi_isl_443875_England_20200330_null_1,epi_isl_444369_England_20200428_null_2,epi_isl_438654_England_20200423_null_1,epi_isl_444398_England_20200419_null_28)Node438,epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1)Node437,epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_423719_England_20200323_null_1,epi_isl_442559_England_20200412_null_1,epi_isl_423784_England_20200322_null_1,epi_isl_444080_England_20200404_null_1,epi_isl_442609_England_20200408_null_1,(epi_isl_443508_England_20200413_null_1,epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11)Node1007,epi_isl_442311_England_20200407_null_1,epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_442484_England_20200331_null_1,epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1,epi_isl_443378_England_20200416_null_1,epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4,epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1,epi_isl_439562_England_20200323_null_1,epi_isl_447003_Bangkok_20200329_null_1,epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_439444_England_20200401_null_2,epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1,(epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6,epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2)Node164,epi_isl_442571_England_20200410_null_1,epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1,epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1,epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1,epi_isl_447238_Kinshasa_20200424_null_1,epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1,epi_isl_439648_England_20200322_null_4,epi_isl_442806_England_20200404_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_442247_England_20200405_null_2,epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_442239_England_20200406_null_1,epi_isl_444244_England_20200419_null_1,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11,epi_isl_442090_England_20200406_null_1,epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1,epi_isl_442721_England_20200405_null_1,epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1,epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4,epi_isl_442261_England_20200407_null_1,epi_isl_442366_England_20200409_null_5,epi_isl_443932_England_20200326_null_1,(epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2,epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1)Node214,epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2,(epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1)Node219,epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6,epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5,epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1,epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2,epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1,epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_439427_England_20200330_null_2,epi_isl_442916_England_20200408_null_1,epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_447404_North_District_20200401_null_22131,epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1,epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_440056_England_20200321_null_2,epi_isl_442982_England_20200407_null_6,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2,epi_isl_439903_England_20200401_null_1,epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_3,epi_isl_443344_England_20200416_null_2,epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1,epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_443488_England_20200415_null_2,epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1,epi_isl_440728_England_20200405_null_2,epi_isl_443513_England_20200415_null_7,epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7,epi_isl_440422_England_20200317_null_1,epi_isl_444420_England_20200419_null_3,epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1,epi_isl_441277_England_20200402_null_1,epi_isl_444373_England_20200429_null_5,epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1,epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3,epi_isl_444293_England_20200413_null_1,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2,epi_isl_439466_England_20200401_null_1,epi_isl_443778_England_20200330_null_5,epi_isl_436959_LA_20200405_null_1,epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2,epi_isl_444218_England_20200415_null_1,epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1,epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5,epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4,epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1,epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8,epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1,epi_isl_443754_England_20200326_null_1,epi_isl_444243_England_20200419_null_2,epi_isl_437572_California_20200421_null_2,epi_isl_444240_England_20200418_null_1,epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1,epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2,epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1,epi_isl_443070_England_20200411_null_1,epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1,epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3,epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1,epi_isl_438432_England_20200329_null_1,epi_isl_445045_Florida_20200428_null_1,epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_441740_England_20200406_null_3,epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_440298_England_20200314_null_1,epi_isl_442025_England_20200411_null_4,epi_isl_444077_California_20200430_null_5,epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1,epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3,epi_isl_444257_England_20200419_null_3,epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1,epi_isl_439664_England_20200330_null_1,epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1,epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3,epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1,epi_isl_438337_England_20200330_null_1,epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1,epi_isl_440024_England_20200322_null_1,epi_isl_446380_Wales_20200409_null_1,epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1,epi_isl_441321_England_20200401_null_3,epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1,(epi_isl_435596_California_20200304_null_2,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_440193_England_20200321_null_1)Node370,(epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1)Node375,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1,epi_isl_445897_Wales_20200331_null_12,epi_isl_442962_England_20200407_null_1,epi_isl_443035_England_20200410_null_1,epi_isl_443592_England_20200412_null_1,epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2,epi_isl_441269_England_20200402_null_1,epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1,epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1,(epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1)Node403,epi_isl_444954_Unknown_20200331_null_11,epi_isl_442433_England_20200404_null_4,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1,((epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_440907_England_20200420_null_1)Node427,epi_isl_439985_England_20200322_null_1)Node426,(epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1,(epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1)Node419,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29)Node414,(epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1)Node423,epi_isl_440623_England_20200402_null_1,epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1,epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1,epi_isl_441078_England_20200403_null_1,epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2,(epi_isl_442153_England_20200406_null_1,epi_isl_444215_England_20200415_null_5)Node1000,epi_isl_439513_England_20200331_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1000":"test",
"Node1007":"test",
"Node1022":"test",
"Node1023":"test",
"Node1068":"test",
"Node1097":"test",
"Node1100":"test",
"Node1144":"test",
"Node1199":"test",
"Node1203":"test",
"Node1206":"test",
"Node1209":"test",
"Node1212":"test",
"Node1215":"test",
"Node1218":"test",
"Node1221":"test",
"Node1224":"test",
"Node1227":"test",
"Node1230":"test",
"Node1233":"test",
"Node1236":"test",
"Node1242":"test",
"Node1245":"test",
"Node1248":"test",
"Node1251":"test",
"Node1254":"test",
"Node1257":"test",
"Node1263":"test",
"Node1266":"test",
"Node1269":"test",
"Node1275":"test",
"Node1278":"test",
"Node1281":"test",
"Node1284":"test",
"Node1287":"test",
"Node1293":"test",
"Node1296":"test",
"Node1299":"test",
"Node1302":"test",
"Node1305":"test",
"Node1308":"test",
"Node1311":"test",
"Node164":"test",
"Node214":"test",
"Node219":"test",
"Node370":"test",
"Node375":"test",
"Node403":"test",
"Node414":"test",
"Node419":"test",
"Node423":"test",
"Node426":"test",
"Node427":"test",
"Node437":"test",
"Node438":"test",
"Node451":"test",
"Node458":"test",
"Node465":"test",
"Node479":"test",
"Node480":"test",
"Node492":"test",
"Node501":"test",
"Node506":"test",
"Node512":"test",
"Node513":"test",
"Node522":"test",
"Node529":"test",
"Node530":"test",
"Node537":"test",
"Node540":"test",
"Node541":"test",
"Node549":"test",
"Node590":"test",
"Node649":"test",
"Node656":"test",
"Node660":"test",
"Node664":"test",
"Node670":"test",
"Node687":"test",
"Node691":"test",
"Node694":"test",
"Node697":"test",
"Node700":"test",
"Node703":"test",
"Node707":"test",
"Node710":"test",
"Node713":"test",
"Node716":"test",
"Node719":"test",
"Node722":"test",
"Node725":"test",
"Node728":"test",
"Node731":"test",
"Node734":"test",
"Node735":"test",
"Node739":"test",
"Node744":"test",
"Node747":"test",
"Node752":"test",
"Node753":"test",
"Node757":"test",
"Node758":"test",
"Node762":"test",
"Node763":"test",
"Node767":"test",
"Node768":"test",
"Node772":"test",
"Node773":"test",
"Node781":"test",
"Node789":"test",
"Node792":"test",
"Node797":"test",
"Node800":"test",
"Node803":"test",
"Node809":"test",
"Node810":"test",
"Node818":"test",
"Node819":"test",
"Node829":"test",
"Node830":"test",
"Node835":"test",
"Node836":"test",
"Node840":"test",
"Node841":"test",
"Node848":"test",
"Node849":"test",
"Node853":"test",
"Node866":"test",
"Node871":"test",
"Node875":"test",
"Node876":"test",
"Node886":"test",
"Node894":"test",
"Node897":"test",
"Node900":"test",
"Node915":"test",
"Node922":"test",
"Node948":"test",
"Node951":"test",
"Node952":"test",
"Node965":"test",
"Node978":"test",
"Node979":"test",
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":"background",
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"background",
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":"background",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"background",
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"background",
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":"background",
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":"background",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"background",
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":"background",
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":"background",
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":"background",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":"background",
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":"background",
"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_433875_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":"background",
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29":"background",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8":"background",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":"background",
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":"background",
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12":"background",
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8":"background",
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8":"background",
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439512_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439528_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":"background",
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":"background",
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442025_England_20200411_null_4":"background",
"epi_isl_442055_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442107_England_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":"background",
"epi_isl_442433_England_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442649_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442823_England_20200411_null_15":"background",
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":"background",
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":"background",
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443379_England_20200415_null_4":"background",
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443411_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443473_England_20200414_null_39":"background",
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":"background",
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_443778_England_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444151_England_20200409_null_10":"background",
"epi_isl_444193_England_20200414_null_10":"background",
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444219_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444238_England_20200418_null_4":"background",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_444248_England_20200418_null_4":"background",
"epi_isl_444257_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444373_England_20200429_null_5":"background",
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":"background",
"epi_isl_444420_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16":"background",
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":"background",
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9":"background",
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_444954_Unknown_20200331_null_11":"background",
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60":"background",
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_445012_Florida_20200417_null_5":"background",
"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_445039_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445045_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_445084_Texas_20200325_null_66":"background",
"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_445110_California_20200326_null_56":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_445162_Louisiana_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_6":"background",
"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_11":"background",
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_445521_Wales_20200403_null_6":"background",
"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_445600_Wales_20200406_null_21":"background",
"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_445654_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445701_Wales_20200412_null_17":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11":"background",
"epi_isl_445897_Wales_20200331_null_12":"background",
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_446016_Wales_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_446175_Wales_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11":"background",
"epi_isl_446233_Wales_20200406_null_30":"background",
"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9":"background",
"epi_isl_446380_Wales_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_13":"background",
"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446534_Wales_20200411_null_53":"background",
"epi_isl_446552_Wales_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9":"background",
"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446790_Wales_20200421_null_62":"background",
"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_446807_Wales_20200416_null_8":"background",
"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_446915_Wales_20200417_null_138":"background",
"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5":"background",
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_446996_Bangkok_20200328_null_6":"background",
"epi_isl_447003_Bangkok_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_447013_Bangkok_20200303_null_8":"background",
"epi_isl_447029_Bangkok_20200407_null_30":"background",
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_447032_Gujarat_20200503_null_6":"background",
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4":"background",
"epi_isl_447054_Constanta_20200430_null_5":"background",
"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_447187_Michigan_20200313_null_290":"background",
"epi_isl_447191_Michigan_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_447226_Michigan_20200422_null_13":"background",
"epi_isl_447238_Kinshasa_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6":"background",
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_1729":"background",
"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_22131":"background",
"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":51
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":13
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":65
}
}
}